More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0597 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
142 aa  295  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.59 
 
 
144 aa  184  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  58.82 
 
 
142 aa  174  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.89 
 
 
157 aa  168  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  51.47 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.29 
 
 
152 aa  144  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 
143 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.04 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  53.12 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.75 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.85 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 
150 aa  128  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  45.71 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  47.69 
 
 
143 aa  127  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  46.38 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  47.18 
 
 
144 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  44.7 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.59 
 
 
139 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  46.53 
 
 
151 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  41.73 
 
 
154 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.62 
 
 
137 aa  121  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 
143 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2792  protein tyrosine phosphatase  43.33 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  45.26 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  45.32 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  46.83 
 
 
132 aa  117  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.44 
 
 
137 aa  117  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.38 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.38 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  44.06 
 
 
148 aa  114  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.19 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  44.19 
 
 
140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  44.93 
 
 
144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.23 
 
 
139 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  42.86 
 
 
144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
164 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
145 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.12 
 
 
141 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  45.99 
 
 
287 aa  110  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  45.32 
 
 
498 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  44.93 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
258 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.32 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.86 
 
 
453 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
132 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
255 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.38 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  46.62 
 
 
254 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.38 
 
 
138 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
165 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  45.67 
 
 
127 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
143 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  43.8 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  42.65 
 
 
144 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  45.3 
 
 
164 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 
142 aa  104  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 
143 aa  104  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  40.44 
 
 
171 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  41.48 
 
 
254 aa  104  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
170 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  42.4 
 
 
177 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
146 aa  103  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  45.32 
 
 
144 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
145 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 
174 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  44.29 
 
 
142 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
173 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 
142 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
153 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  45.32 
 
 
135 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
258 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.88 
 
 
139 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.77 
 
 
136 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 
173 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 
159 aa  100  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  41.84 
 
 
141 aa  100  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  45 
 
 
165 aa  100  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  38.13 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  37.23 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.46 
 
 
167 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
167 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.57 
 
 
139 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.18 
 
 
156 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  41.6 
 
 
167 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  38.13 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.46 
 
 
164 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  40.46 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.55 
 
 
172 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  44.03 
 
 
294 aa  97.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.96 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>