More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0538 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  100 
 
 
432 aa  857    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  63 
 
 
437 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  53.26 
 
 
431 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  54.29 
 
 
432 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  52.63 
 
 
432 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  46.48 
 
 
434 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  45.58 
 
 
428 aa  328  9e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  45.8 
 
 
435 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  28.5 
 
 
437 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  28.43 
 
 
441 aa  136  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  26.68 
 
 
437 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.27 
 
 
428 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  28.12 
 
 
428 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  26.79 
 
 
471 aa  123  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.37 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 
394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  30.42 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  30.41 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4313  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 
528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  29.87 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  27.99 
 
 
458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
415 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  27.75 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  29.01 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  28.31 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  28.31 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 
423 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
426 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.72 
 
 
440 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 
437 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  28.31 
 
 
437 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
435 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.51 
 
 
426 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.62 
 
 
493 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  29.67 
 
 
425 aa  104  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 
421 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.42 
 
 
479 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  27.1 
 
 
443 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
438 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  27.1 
 
 
452 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  27.1 
 
 
461 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  27.1 
 
 
461 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  27.1 
 
 
461 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  27.1 
 
 
461 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 
424 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  26.83 
 
 
443 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  30.13 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  30.13 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.26 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  26.76 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  26.39 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 
418 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 
446 aa  94  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.83 
 
 
432 aa  93.2  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  26.47 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  24.37 
 
 
440 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  29.5 
 
 
436 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 
451 aa  89.7  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 
443 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  25.06 
 
 
422 aa  86.3  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  27.3 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  26.38 
 
 
424 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  23.53 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  26.53 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  24.64 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 
485 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
413 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  24 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  26.11 
 
 
451 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 
523 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  23.62 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.11 
 
 
500 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
492 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  23.75 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  28.16 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  20.69 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 
485 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  24.65 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  24.32 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>