25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0476 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0476  DNA polymerase B, exonuclease  100 
 
 		 707 aa  1440    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0121312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3187  DNA polymerase B, exonuclease  37.43 
 
 		 744 aa  459  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3245  DNA polymerase II, putative  36.83 
 
 		 745 aa  445  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  35.4 
 
 		 743 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  27.9 
 
 		 796 aa  310  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  27.17 
 
 		 793 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  27.98 
 
 		 796 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  27.21 
 
 		 788 aa  291  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1412  DNA polymerase B region  32.05 
 
 		 785 aa  290  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  28.04 
 
 		 800 aa  290  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0006  DNA polymerase B region  26.2 
 
 		 811 aa  280  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  26.51 
 
 		 792 aa  267  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2799  DNA polymerase B region  24.76 
 
 		 735 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  24.69 
 
 		 794 aa  63.5  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  24.15 
 
 		 784 aa  60.8  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  24.33 
 
 		 783 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  21.18 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  22.48 
 
 		 785 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  24.91 
 
 		 781 aa  56.2  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  23.81 
 
 		 786 aa  55.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  27.69 
 
 		 788 aa  54.7  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  30.12 
 
 		 941 aa  49.3  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  33.64 
 
 		 786 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  33.64 
 
 		 786 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  17.92 
 
 		 607 aa  44.3  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>