More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0404 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
481 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 
480 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 
480 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
487 aa  1007    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  67.15 
 
 
485 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  70.18 
 
 
493 aa  746    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  65.18 
 
 
494 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 
481 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
493 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
479 aa  551  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
455 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 
485 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
485 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 
485 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
483 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
485 aa  511  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 
490 aa  509  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
463 aa  501  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
461 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
461 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
505 aa  500  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
461 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
459 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
465 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
459 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
465 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  51.83 
 
 
485 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
459 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
468 aa  497  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
460 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
459 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 
485 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
459 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
461 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
459 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
464 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
461 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
459 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
459 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
461 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
459 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
459 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
461 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
485 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
466 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
460 aa  488  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
459 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
461 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
461 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
461 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
454 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  52.26 
 
 
461 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
486 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
456 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
478 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
461 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
461 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
459 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
488 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
466 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
461 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
461 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
461 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
461 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
461 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 
454 aa  478  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
461 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
461 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
461 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
460 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
466 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
488 aa  477  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
465 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
500 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
473 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
482 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
466 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
461 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
461 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
460 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
461 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
456 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
461 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
460 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
459 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
461 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
461 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
460 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>