212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0371 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 171 aa  347  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  60.81 
 
 		 169 aa  197  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  50 
 
 		 179 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  45.71 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  45.09 
 
 		 183 aa  150  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  57.45 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  52.6 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  42.2 
 
 		 180 aa  134  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  47.59 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  40.24 
 
 		 232 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  48.57 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  38.98 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  40.96 
 
 		 221 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  41.01 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  36.48 
 
 		 244 aa  111  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  40.37 
 
 		 221 aa  111  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  38.42 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  38.36 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  37.68 
 
 		 238 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  39.86 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  33.93 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  34.52 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  36.81 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  33.33 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  35.98 
 
 		 206 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35.62 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  39.86 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  35.76 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  37.28 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  43.26 
 
 		 162 aa  97.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.52 
 
 		 174 aa  97.8  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  40.41 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  40.71 
 
 		 196 aa  94.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  35.26 
 
 		 227 aa  94.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.93 
 
 		 169 aa  94  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  36.71 
 
 		 153 aa  94  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  33.12 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.64 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  41.88 
 
 		 194 aa  90.5  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  42.86 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  36.88 
 
 		 225 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  33.54 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  34.16 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  33.54 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  42.5 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  36.76 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  34.36 
 
 		 226 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30.91 
 
 		 184 aa  85.5  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  35.06 
 
 		 175 aa  84.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  35.03 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  35.67 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  34.97 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  37.01 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  35.62 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  33.13 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  30.86 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  41.09 
 
 		 136 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  37.42 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  37.42 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  36.36 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  34.57 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  30.32 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.12 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32.78 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  33.55 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  32.84 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  37.75 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  32.72 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  31.76 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  32.12 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  32.08 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  35.71 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  34.06 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  34.06 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.05 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  34.55 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  35 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  35.57 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  37.96 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.6 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  32.2 
 
 		 278 aa  67.8  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  37.96 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.71 
 
 		 271 aa  67.8  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  32.92 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.29 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  34.06 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  34.21 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  33.13 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  37.76 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  32.05 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  36.76 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  33.97 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  37.59 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  31.58 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.28 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  33.77 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  32.47 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  29.29 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>