More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0357 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
310 aa  620  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  70.86 
 
 
305 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  68.2 
 
 
307 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  67.88 
 
 
305 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  66.23 
 
 
309 aa  378  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  52.94 
 
 
306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  43.97 
 
 
307 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
348 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.52 
 
 
312 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
311 aa  186  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
304 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
327 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  37.41 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 
328 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
334 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
330 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
330 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
330 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
342 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  35.83 
 
 
354 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  35.83 
 
 
349 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 
329 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
333 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  35.41 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  33.56 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
341 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
335 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
331 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
340 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
341 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
341 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  32.8 
 
 
341 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
337 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  32.98 
 
 
333 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  34.89 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  35.13 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  33.45 
 
 
341 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
341 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
323 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
312 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  35.15 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
317 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
340 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.28 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  34.54 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.94 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  34.65 
 
 
331 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.94 
 
 
207 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  32.67 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
206 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  32.9 
 
 
326 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
212 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  32.25 
 
 
326 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  32.4 
 
 
206 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  31.92 
 
 
326 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.71 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.34 
 
 
420 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  46.34 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.5 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.81 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  41.75 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.58 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  42.17 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  46.75 
 
 
105 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
112 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  41.13 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.79 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.79 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.86 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.26 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.72 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  25.27 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.21 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.2 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
132 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
117 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.38 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>