More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0339 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  74.63 
 
 
202 aa  315  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  68.97 
 
 
210 aa  289  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  70.44 
 
 
203 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  68.69 
 
 
198 aa  280  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  72.08 
 
 
208 aa  278  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  67.4 
 
 
207 aa  254  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  49.25 
 
 
202 aa  206  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  49.5 
 
 
202 aa  188  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  46.73 
 
 
201 aa  187  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  50.25 
 
 
201 aa  184  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  46.46 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  44.5 
 
 
203 aa  177  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  49.12 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  48.15 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  49.12 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  41 
 
 
195 aa  167  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  42.41 
 
 
200 aa  158  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  42.42 
 
 
208 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  42.05 
 
 
202 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 
216 aa  149  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.43 
 
 
203 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  39.5 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  40.8 
 
 
218 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  40.8 
 
 
218 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  40.53 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  37.25 
 
 
212 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  41.87 
 
 
213 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  41.14 
 
 
202 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  39.8 
 
 
218 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  37.69 
 
 
208 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.66 
 
 
222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  38.83 
 
 
201 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  36.61 
 
 
212 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  44.38 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  39.39 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  38.73 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  39.9 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  35.41 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  35.98 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  37.3 
 
 
203 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  38.69 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  38.14 
 
 
215 aa  128  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  37.56 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  37.37 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  34.92 
 
 
202 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  37.72 
 
 
209 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  36.09 
 
 
198 aa  121  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.57 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  39.26 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.25 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  36.05 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  35.92 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.27 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  37.19 
 
 
205 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  37.58 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  40.99 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.65 
 
 
241 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  41.77 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  37.3 
 
 
224 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  35.5 
 
 
205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  32.34 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  32.34 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  32.34 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  37.43 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  32.34 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  33.66 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  32.34 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  34.03 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  31.84 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  30.05 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  33.51 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  38.12 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  29.7 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  35.63 
 
 
325 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  30.05 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.24 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  32.84 
 
 
201 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  32.53 
 
 
201 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  37.13 
 
 
201 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  32.53 
 
 
201 aa  111  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  32.53 
 
 
201 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  37.13 
 
 
201 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  32.53 
 
 
201 aa  111  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  34.65 
 
 
215 aa  111  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  32.72 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  32.72 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  37.72 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  37.13 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  31.84 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  37.13 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.01 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  37.82 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  31.34 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.48 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  34.03 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.67 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  34.03 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>