More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0231 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  86.67 
 
 
240 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  84.98 
 
 
233 aa  407  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  87.05 
 
 
228 aa  397  1e-110  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 
234 aa  349  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  55.8 
 
 
235 aa  254  1e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  49.55 
 
 
243 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  49.56 
 
 
236 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  48.66 
 
 
245 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  48.46 
 
 
234 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  54.05 
 
 
230 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  49.33 
 
 
234 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  47.77 
 
 
241 aa  224  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  45.96 
 
 
234 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  48.21 
 
 
244 aa  222  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  221  1e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  221  1e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 
237 aa  221  1e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  52.49 
 
 
246 aa  219  4e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  219  4e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  219  4e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  219  4e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  219  4e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  47.95 
 
 
236 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  47.03 
 
 
236 aa  216  3e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  48.18 
 
 
243 aa  213  2e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  47.03 
 
 
236 aa  213  3e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  47.73 
 
 
244 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
259 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.9 
 
 
228 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  46.58 
 
 
235 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
220 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  46.29 
 
 
244 aa  201  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  47.03 
 
 
235 aa  201  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  46.05 
 
 
246 aa  201  1e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47.09 
 
 
220 aa  198  8e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  43.97 
 
 
242 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.1 
 
 
242 aa  197  1e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  45.29 
 
 
225 aa  197  1e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.32 
 
 
225 aa  195  5e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.18 
 
 
256 aa  195  5e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.32 
 
 
225 aa  195  5e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  43.29 
 
 
231 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  43.04 
 
 
237 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  48 
 
 
254 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
223 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  43.18 
 
 
244 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  43.53 
 
 
242 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 
239 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
223 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.78 
 
 
230 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  41.89 
 
 
233 aa  189  3e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
224 aa  189  3e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  43.18 
 
 
237 aa  189  3e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  41.92 
 
 
242 aa  189  3e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  43.18 
 
 
237 aa  189  3e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  42.99 
 
 
232 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  44.59 
 
 
247 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 
238 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  44.69 
 
 
245 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  40.27 
 
 
223 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 
229 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  44.44 
 
 
653 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  43.44 
 
 
652 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.79 
 
 
232 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  44.25 
 
 
237 aa  185  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  42.61 
 
 
233 aa  184  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  39.74 
 
 
227 aa  184  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.61 
 
 
232 aa  184  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  41.89 
 
 
229 aa  184  1e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.09 
 
 
234 aa  184  1e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 
232 aa  184  1e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.09 
 
 
234 aa  184  1e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  42.36 
 
 
250 aa  183  2e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.61 
 
 
233 aa  183  2e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.74 
 
 
228 aa  183  2e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  43.61 
 
 
247 aa  183  2e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  42.79 
 
 
277 aa  183  2e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  43.48 
 
 
227 aa  183  2e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  45.33 
 
 
225 aa  183  2e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  1.73721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  41.41 
 
 
252 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  41.53 
 
 
232 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  42.41 
 
 
229 aa  182  4e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  42.79 
 
 
228 aa  182  4e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  41.3 
 
 
223 aa  182  4e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  42.53 
 
 
230 aa  182  4e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 
239 aa  182  4e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
227 aa  181  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  2.07745e-09  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  181  8e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 
233 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.67827e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 
233 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.67258e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.47 
 
 
264 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  42.53 
 
 
280 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>