More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0127 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  65.8 
 
 		 215 aa  276  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  65.8 
 
 		 196 aa  275  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  67.88 
 
 		 196 aa  273  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  48.7 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 212 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 212 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 212 aa  175  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  42.78 
 
 		 219 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  41.85 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 205 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  40.45 
 
 		 219 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  41.44 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  41.4 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 210 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  43.06 
 
 		 162 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  33.14 
 
 		 194 aa  110  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
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NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 176 aa  99  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  32.02 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 200 aa  98.2  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  32.96 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01619  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.54 
 
 		 171 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000798557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01609  hypothetical protein  33.54 
 
 		 171 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000476829  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  29.12 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  32.58 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 202 aa  87.8  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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