More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0123 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  84.24 
 
 
186 aa  332  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  73.91 
 
 
186 aa  289  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  70.65 
 
 
186 aa  280  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  69.35 
 
 
188 aa  268  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  44.86 
 
 
176 aa  171  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  47.28 
 
 
178 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  46.74 
 
 
194 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  46.2 
 
 
194 aa  167  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  42.39 
 
 
178 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  39.57 
 
 
180 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  41.3 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  38.83 
 
 
176 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  36.7 
 
 
169 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  38.04 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  36.17 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.07 
 
 
163 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  34.27 
 
 
175 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  34.92 
 
 
180 aa  106  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  32.43 
 
 
166 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  35.63 
 
 
174 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  34.64 
 
 
168 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  32.43 
 
 
166 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  37.08 
 
 
192 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  34.83 
 
 
278 aa  97.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  31.61 
 
 
175 aa  97.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  32.98 
 
 
169 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.61 
 
 
165 aa  97.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.46 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.16 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  34.12 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  35.93 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  34.57 
 
 
171 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  34.57 
 
 
171 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  32.32 
 
 
163 aa  94.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.37 
 
 
204 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.45 
 
 
169 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  34.08 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.41 
 
 
197 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  32.8 
 
 
175 aa  92.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  32.24 
 
 
176 aa  91.3  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  34.21 
 
 
196 aa  91.3  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  35.52 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  35.26 
 
 
190 aa  90.9  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  31.38 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  31.22 
 
 
274 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.57 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.32 
 
 
171 aa  89  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.72 
 
 
169 aa  89  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.86 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  34.3 
 
 
169 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.51 
 
 
171 aa  89  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.73 
 
 
175 aa  88.6  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.23 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.17 
 
 
207 aa  87.8  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.29 
 
 
214 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  32.29 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  32.42 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  31.95 
 
 
170 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  35.08 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.42 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.99 
 
 
584 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  32.81 
 
 
170 aa  87  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  32.61 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  27.88 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.29 
 
 
222 aa  85.1  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.84 
 
 
213 aa  85.1  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  29.41 
 
 
173 aa  84.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.34 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  32.57 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.05 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.49 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  30.77 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.86 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.88 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.03 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.19 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  30.3 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  30.77 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.56 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.77 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  28.18 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  31.73 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  30.89 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.11 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  29.79 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.37 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.24 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  32.12 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  30.57 
 
 
240 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  31.6 
 
 
280 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.36 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.67 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.56 
 
 
230 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.5 
 
 
231 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  30.69 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1674  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.5 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505053  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  27.37 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.5 
 
 
214 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.22 
 
 
324 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>