289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0054 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 968 aa  1950    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  33.01 
 
 		 1328 aa  415  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 1215 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 		 1186 aa  360  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 		 1507 aa  345  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31.24 
 
 		 919 aa  323  9.000000000000001e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.03 
 
 		 1475 aa  253  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 937 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 1054 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.5 
 
 		 767 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  35.22 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1409 aa  174  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 		 771 aa  172  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 454 aa  171  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 568 aa  171  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.45 
 
 		 568 aa  171  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  31.1 
 
 		 1185 aa  168  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 843 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1039 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1105 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 		 1262 aa  164  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  33.6 
 
 		 1044 aa  163  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 1365 aa  160  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 924 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 1050 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.77 
 
 		 885 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  31.99 
 
 		 799 aa  152  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 		 787 aa  151  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.03 
 
 		 991 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 		 1128 aa  148  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  34.69 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  36.65 
 
 		 672 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 		 1288 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.87 
 
 		 1162 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 444 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1162 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  29.69 
 
 		 1488 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1550 aa  132  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.52 
 
 		 991 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 916 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 911 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.36 
 
 		 2145 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.91 
 
 		 822 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1060 aa  128  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 751 aa  127  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 1025 aa  127  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  30.03 
 
 		 977 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.33 
 
 		 1131 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 851 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  30.16 
 
 		 362 aa  120  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 		 1125 aa  120  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  31.35 
 
 		 825 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 854 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 481 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.03 
 
 		 732 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.47 
 
 		 1424 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.3 
 
 		 1009 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 949 aa  110  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  33.33 
 
 		 311 aa  107  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.39 
 
 		 493 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.49 
 
 		 2741 aa  105  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.55 
 
 		 532 aa  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  29.65 
 
 		 893 aa  104  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1404 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.78 
 
 		 2741 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 469 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  33.97 
 
 		 212 aa  101  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 953 aa  101  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  28.98 
 
 		 717 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  21.64 
 
 		 828 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  44.25 
 
 		 729 aa  99  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  23.97 
 
 		 828 aa  97.8  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 923 aa  97.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.38 
 
 		 854 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1283 aa  95.9  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  26.84 
 
 		 1056 aa  95.1  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 814 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 868 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 785 aa  92  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.67 
 
 		 3537 aa  91.3  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 190 aa  90.9  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1028 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1247 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 837 aa  90.1  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  25.46 
 
 		 919 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.16 
 
 		 854 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  27.44 
 
 		 884 aa  90.1  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.62 
 
 		 809 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 669 aa  89.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1088 aa  89  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 857 aa  88.6  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  29.34 
 
 		 950 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  29.34 
 
 		 950 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.13 
 
 		 3298 aa  88.2  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  33.61 
 
 		 963 aa  88.2  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 928 aa  87.8  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.87 
 
 		 3535 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.87 
 
 		 3419 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1246 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>