48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0048 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
204 aa  426  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  65.61 
 
 
202 aa  255  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  29.41 
 
 
693 aa  85.1  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  37.9 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  30.3 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  30.89 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  30.89 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  26.9 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  30.58 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03075  putative tyrosine specific protein phosphatase  34.84 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1524  protein tyrosine/serine phosphatase  34.53 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  30 
 
 
363 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  27.78 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  34.27 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  32.14 
 
 
244 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0444  hypothetical protein  30.58 
 
 
242 aa  55.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61269  tyrosine phosphatase  25.38 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.115232  normal  0.236513 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02810  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568047  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04520  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000490749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  26.83 
 
 
244 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  35.16 
 
 
182 aa  51.2  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  30.91 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58142  putative tyrosine phosphatase  23.53 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.973876  normal  0.993909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  36.7 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  25.23 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  28.21 
 
 
221 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61589  predicted protein  27.33 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04310  cytoplasm protein, putative  26.56 
 
 
190 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.060224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  25.53 
 
 
141 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46361  protein tyrosine/serine phosphatase  25 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  30.53 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  30.53 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0882  hypothetical protein  27.2 
 
 
365 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  31.18 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  32.65 
 
 
166 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  31.58 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  27.93 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  27.93 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  32.67 
 
 
283 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2735  hypothetical protein  26.53 
 
 
319 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  29.47 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  30 
 
 
156 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  27.43 
 
 
241 aa  41.6  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  29.55 
 
 
234 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>