More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0026 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0026  DnaB domain protein  100 
 
 
318 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  50.8 
 
 
456 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  45.73 
 
 
458 aa  285  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  45.89 
 
 
456 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  46.58 
 
 
456 aa  262  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
456 aa  249  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  43.96 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.62 
 
 
449 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  43.96 
 
 
449 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.79 
 
 
442 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  42.2 
 
 
449 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  41.33 
 
 
481 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  43.52 
 
 
442 aa  235  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  45.82 
 
 
460 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.17 
 
 
444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
446 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  42.67 
 
 
441 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  44.09 
 
 
442 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  39.74 
 
 
440 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  39.59 
 
 
470 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  42.11 
 
 
461 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  42.27 
 
 
453 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  42.81 
 
 
444 aa  225  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  37.54 
 
 
471 aa  225  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  39.35 
 
 
446 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  39.48 
 
 
445 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  46.44 
 
 
451 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  46.44 
 
 
451 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  41.14 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  41.08 
 
 
465 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  41.11 
 
 
476 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  38.59 
 
 
452 aa  219  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  41.24 
 
 
459 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  40.97 
 
 
444 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  42.39 
 
 
318 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  40.77 
 
 
476 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  39.33 
 
 
456 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  41.92 
 
 
477 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  38.39 
 
 
453 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  37.74 
 
 
449 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.39 
 
 
453 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.39 
 
 
453 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.39 
 
 
453 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.39 
 
 
453 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.39 
 
 
453 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  42.39 
 
 
453 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.39 
 
 
453 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  37.74 
 
 
453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  44.16 
 
 
472 aa  215  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  40.54 
 
 
446 aa  215  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  43.97 
 
 
456 aa  215  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  40.71 
 
 
450 aa  215  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  44 
 
 
462 aa  215  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  38.67 
 
 
472 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  40.91 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  42.38 
 
 
445 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  38.67 
 
 
472 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  39.72 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  39.72 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  40.26 
 
 
444 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  43.06 
 
 
461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  41.18 
 
 
473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  39.27 
 
 
469 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  41.5 
 
 
445 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  41.7 
 
 
457 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  41.7 
 
 
457 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  37.1 
 
 
452 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  35.69 
 
 
457 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  39.01 
 
 
507 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  42.16 
 
 
471 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  39.62 
 
 
493 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  37.1 
 
 
454 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  41.81 
 
 
471 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  41.81 
 
 
471 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  41.81 
 
 
471 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  37.62 
 
 
508 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  41.81 
 
 
471 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  41.81 
 
 
471 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  41.81 
 
 
471 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  41.81 
 
 
471 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  37.46 
 
 
455 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  41.79 
 
 
454 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  36.77 
 
 
452 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  39.46 
 
 
468 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  39.33 
 
 
450 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  43.34 
 
 
441 aa  209  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  41.81 
 
 
471 aa  208  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  36.45 
 
 
453 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  36.55 
 
 
481 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  39.6 
 
 
447 aa  208  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  37.35 
 
 
493 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  43.56 
 
 
466 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  38.46 
 
 
451 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  40.28 
 
 
462 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  38.03 
 
 
469 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  40.71 
 
 
454 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  37.76 
 
 
472 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  36.13 
 
 
449 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  42.8 
 
 
461 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  41.26 
 
 
470 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>