94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0024 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 330 aa  679    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  41.27 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  37.16 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  36.78 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  36.16 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  34.94 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  35.53 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  36.16 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  33.54 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  30.21 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  28.66 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  31.02 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  30.06 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  28.66 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  31.46 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  29 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  29.76 
 
 		 383 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  29.65 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  31.95 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  28.44 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  29.47 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  28.95 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  30.54 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  30.15 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02534  transcriptional factor  30.12 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  28.48 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  28.11 
 
 		 331 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  28.11 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  28.11 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.06 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  23.43 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  31.07 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  24.77 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.63 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  25.58 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  30.26 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.87 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.48 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  25.69 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5054  transcriptional factor-related protein  39.02 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.87 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0198  transcriptional factor-related protein  38.37 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.69 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0194  hypothetical protein  38.37 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0173  transcriptional factor-related protein  38.37 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.86 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.65 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.74 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0945  putative transcription factor  25.2 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000235014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0269  transcriptional regulator protein-like protein  25.41 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2026  transcriptional factor-related protein  34.57 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  23.11 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.41 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  23.94 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2541  transcriptional factor-related protein  38.81 
 
 		 184 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3176  hypothetical protein  38.81 
 
 		 187 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.09 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.63 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3747  hypothetical protein  24.84 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1187  regulatory protein, DeoR  23.68 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0154  hypothetical protein  42.42 
 
 		 86 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.48 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  23.47 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1376  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.46 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  21.5 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.54 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.02 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  23.55 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  21.5 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  29.28 
 
 		 329 aa  49.3  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  22.99 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.45 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2212  transcriptional factor-related protein  35.82 
 
 		 180 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.555677  normal  0.42409 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5075  regulatory protein, DeoR  25 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  21.82 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.08 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  21.43 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.11 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.12 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 1078 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1228  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.41 
 
 		 335 aa  46.2  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.671066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.83 
 
 		 321 aa  46.2  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  25.14 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  26.83 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  21.14 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  24.6 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3763  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.56 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  24.79 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.5 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  21.14 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.85 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>