22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0012 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  1023    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  50.51 
 
 		 500 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  48.06 
 
 		 491 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  41.8 
 
 		 496 aa  352  8e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  38.34 
 
 		 492 aa  329  6e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  38.19 
 
 		 451 aa  316  6e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  36.63 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  35.93 
 
 		 493 aa  300  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  36.25 
 
 		 486 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  34.96 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  33.74 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  33.69 
 
 		 495 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  29.8 
 
 		 488 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  30.29 
 
 		 534 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  26.22 
 
 		 525 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  33.48 
 
 		 714 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2366  hypothetical protein  27.07 
 
 		 663 aa  113  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  31.05 
 
 		 709 aa  95.5  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 690 aa  64.3  0.000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf308  hypothetical protein  27.04 
 
 		 670 aa  57  0.0000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0619452  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  25.12 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  25.12 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>