22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_R0070 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_R0070  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0030  tRNA-Cys  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129776  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0001  tRNA-Cys  90 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0035  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0041  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.283149  normal  0.794533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0031  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna22  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0031  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000180821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0068  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.505859  hitchhiker  0.00111076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0038  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0036  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0579773 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0018  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0856  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.569143  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0034  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  0.65843 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0040  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101122 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1032  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0925  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0030  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60570  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0043  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00614253  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0039  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00215479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0071  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>