37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3555 on replicon NC_011367
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  100 
 
 		 98 aa  196  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  85.71 
 
 		 98 aa  168  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  55.95 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  58.33 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  48.1 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  48 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  48.57 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  48.57 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  53.97 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  44 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  44.44 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  40.96 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  31.48 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  43.24 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  42.47 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  40.24 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  37.33 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  39.02 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  42.65 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  35.71 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  40.24 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  34.94 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  37.5 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3272  WGR domain-containing protein  46.15 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.705915  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  38.1 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  44.93 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  32.35 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02180  hypothetical protein  40.58 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  39.39 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  40 
 
 		 1422 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  31.94 
 
 		 1291 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>