More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3518 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
347 aa  679    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  67.18 
 
 
326 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  43.65 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  42.77 
 
 
314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  45.75 
 
 
322 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.95 
 
 
310 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.59 
 
 
317 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  49.02 
 
 
337 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  46.75 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  41.5 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  43.32 
 
 
320 aa  242  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  43 
 
 
320 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  38.17 
 
 
320 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.23 
 
 
319 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  41.48 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  41.96 
 
 
649 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  43.14 
 
 
316 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  39.14 
 
 
327 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  39.14 
 
 
327 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  42.76 
 
 
331 aa  229  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  36.91 
 
 
319 aa  222  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  41.04 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  38.19 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  43.95 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  35.8 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  38.02 
 
 
346 aa  196  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  38.14 
 
 
319 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  43.69 
 
 
313 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  43.69 
 
 
313 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.9 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  41.32 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  34.72 
 
 
344 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 
344 aa  179  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  33.93 
 
 
353 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.66 
 
 
352 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 
320 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  35.03 
 
 
354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  38.66 
 
 
359 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  34.63 
 
 
360 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
355 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  35.37 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  34.57 
 
 
340 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  36.61 
 
 
356 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  35.83 
 
 
340 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  35.12 
 
 
340 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  36.74 
 
 
317 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  33.98 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  37.76 
 
 
335 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  34.82 
 
 
356 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  34.82 
 
 
356 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  34.3 
 
 
334 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  33.47 
 
 
334 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 
344 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  38.27 
 
 
346 aa  135  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  31.39 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  39.08 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  33.06 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  37.5 
 
 
345 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  35.39 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  33.95 
 
 
335 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  35.76 
 
 
332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 
361 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  33.86 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  34.38 
 
 
332 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  33.09 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  30.19 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  30.35 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
344 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  39.73 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  32.63 
 
 
334 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 
307 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.2 
 
 
312 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 
318 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
311 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
344 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.51 
 
 
317 aa  101  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.34 
 
 
310 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  30.96 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  31.33 
 
 
305 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  36.4 
 
 
320 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 
334 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 
310 aa  96.3  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  31.77 
 
 
345 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.27 
 
 
288 aa  92.8  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 
303 aa  91.3  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.85 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 
338 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>