More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3444 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3444  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
569 aa  1082    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  37.62 
 
 
425 aa  148  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  37.09 
 
 
421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  38.67 
 
 
613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  28.66 
 
 
598 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  40.78 
 
 
615 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  25.75 
 
 
584 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  35.56 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  39.78 
 
 
454 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  41.53 
 
 
461 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  33.04 
 
 
419 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  32.23 
 
 
460 aa  107  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.52 
 
 
598 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  22.93 
 
 
508 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  40.98 
 
 
460 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.98 
 
 
460 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  38.55 
 
 
601 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.89 
 
 
460 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.15 
 
 
390 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  33.87 
 
 
428 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  33.87 
 
 
428 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  33.87 
 
 
428 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  34.6 
 
 
413 aa  100  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  37.58 
 
 
394 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  30.95 
 
 
462 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  34.6 
 
 
412 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  33.76 
 
 
413 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  33.76 
 
 
413 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  33.76 
 
 
413 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  33.76 
 
 
413 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  33.76 
 
 
413 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  33.76 
 
 
413 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.87 
 
 
456 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  33.44 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  33.09 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  30.67 
 
 
441 aa  95.5  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  42.97 
 
 
402 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  33.73 
 
 
413 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  33.73 
 
 
413 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.66 
 
 
276 aa  94.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0058  flagellar hook protein  38.97 
 
 
545 aa  94.4  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0042  flagellar hook protein  38.97 
 
 
545 aa  94  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0081  flagellar hook protein  38.97 
 
 
545 aa  94  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.74 
 
 
428 aa  93.6  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.74 
 
 
428 aa  93.6  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.5 
 
 
488 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  45.3 
 
 
398 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  32.59 
 
 
413 aa  93.2  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  35.32 
 
 
409 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  30.51 
 
 
462 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  31.75 
 
 
414 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  31.19 
 
 
398 aa  92.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  43.51 
 
 
400 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.87 
 
 
454 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  41.96 
 
 
556 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  42.19 
 
 
413 aa  91.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  28.68 
 
 
404 aa  91.3  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  40.69 
 
 
456 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  35.97 
 
 
845 aa  91.3  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  36.04 
 
 
466 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1843  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40 
 
 
273 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.54 
 
 
462 aa  91.3  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  37.11 
 
 
610 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  38.14 
 
 
461 aa  90.9  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  43.51 
 
 
400 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  35.97 
 
 
838 aa  90.9  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  33.72 
 
 
410 aa  90.5  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  34.53 
 
 
875 aa  90.5  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.1 
 
 
435 aa  90.5  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  37.4 
 
 
433 aa  90.1  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  46.43 
 
 
395 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  36.77 
 
 
599 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  36 
 
 
464 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  43.59 
 
 
399 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  36.09 
 
 
405 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  31.09 
 
 
413 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  30.56 
 
 
404 aa  89.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  37.29 
 
 
623 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.61 
 
 
431 aa  88.6  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  37.29 
 
 
750 aa  88.6  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.7 
 
 
413 aa  88.2  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  42.52 
 
 
404 aa  88.2  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 
414 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  37.5 
 
 
440 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 
414 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 
414 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  35.16 
 
 
401 aa  87.4  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  39.57 
 
 
263 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  30.34 
 
 
718 aa  87.4  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  31.73 
 
 
401 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  32.88 
 
 
705 aa  87  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  29.66 
 
 
441 aa  87  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  30.66 
 
 
442 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  32.55 
 
 
403 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.99 
 
 
397 aa  86.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  31.25 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  30.22 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.43 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  35.43 
 
 
819 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>