212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3442 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 253 aa  487  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  37.35 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  34.04 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  32.9 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  31.33 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  33.61 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  35.19 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  30.54 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  32.19 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  33.49 
 
 		 253 aa  111  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  33.05 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  31.17 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  34.39 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  34.02 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  31.33 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  35.25 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  34.04 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  31.76 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  26.25 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  31.67 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  25.42 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  25.82 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  27.03 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  27.73 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  27.69 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  27.47 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  26.32 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  25.39 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  29 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  30.25 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  27.43 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  24.9 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  29.87 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  26.56 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  25.88 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  25.56 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  26.11 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  26.81 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  29.52 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  27.6 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  28.35 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  26.29 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  26.07 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  32.6 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  24.61 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  24.68 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  26.27 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  28.8 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  26.14 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  29.18 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  24.78 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  27.14 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  27.14 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  24.9 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  27.48 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  23.38 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  27.48 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  27.03 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  26.58 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  27.18 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  26.58 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  26.12 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  23.5 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  21.48 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  24.35 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  24.69 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  26.38 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  27.06 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  26.29 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  20.58 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  26.38 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  26.89 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  24.89 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  26.58 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  26.43 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  24.79 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  25.68 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  27.93 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  25.68 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  24.78 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  27.59 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  25.68 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  25.68 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  26.05 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  28.05 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  25.69 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  26.38 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  22.02 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  22.02 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  25.62 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  25.96 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  26.51 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>