More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3423 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 601 aa  1212    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  56.18 
 
 		 568 aa  578  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  52.01 
 
 		 584 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  49.74 
 
 		 603 aa  522  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  48.64 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  48.82 
 
 		 576 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  48.28 
 
 		 576 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  48.28 
 
 		 573 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  46.7 
 
 		 608 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  48.45 
 
 		 576 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  48.46 
 
 		 573 aa  498  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  46.61 
 
 		 839 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  46.17 
 
 		 574 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  45.01 
 
 		 585 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 958 aa  301  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 942 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  36.23 
 
 		 1779 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.88 
 
 		 1801 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.38 
 
 		 3235 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.71 
 
 		 2762 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 947 aa  273  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  32.37 
 
 		 2997 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.36 
 
 		 3231 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  33.82 
 
 		 936 aa  270  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  33.64 
 
 		 852 aa  270  8e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 		 958 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.31 
 
 		 3208 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.77 
 
 		 4317 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  35.57 
 
 		 1789 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.79 
 
 		 1776 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  34.21 
 
 		 4317 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.63 
 
 		 4317 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 949 aa  260  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.56 
 
 		 4342 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.6 
 
 		 4318 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 586 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 962 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.01 
 
 		 4336 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.57 
 
 		 4336 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  33.78 
 
 		 4342 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  32.97 
 
 		 2791 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 578 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 592 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 586 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.88 
 
 		 6403 aa  253  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  34.1 
 
 		 4332 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.4 
 
 		 4317 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.48 
 
 		 2250 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  33.33 
 
 		 1067 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 611 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  33.51 
 
 		 2820 aa  250  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.53 
 
 		 1656 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 725 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 725 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  34.82 
 
 		 1474 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  34.83 
 
 		 2721 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  34.54 
 
 		 609 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.33 
 
 		 3718 aa  242  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.31 
 
 		 7122 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.95 
 
 		 563 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.63 
 
 		 546 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 597 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 599 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 597 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  35.41 
 
 		 1981 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  33.81 
 
 		 755 aa  233  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 653 aa  233  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 1272 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  30.81 
 
 		 1753 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  30.34 
 
 		 738 aa  231  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 602 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.01 
 
 		 581 aa  231  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 586 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  30.46 
 
 		 581 aa  229  8e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  28.93 
 
 		 559 aa  229  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  28.93 
 
 		 564 aa  229  8e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 1035 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  29.85 
 
 		 2753 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  30.47 
 
 		 588 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 701 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 686 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.16 
 
 		 629 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  34.16 
 
 		 610 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 614 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.78 
 
 		 629 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 588 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  30.82 
 
 		 635 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 629 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 629 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  34.16 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 608 aa  224  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 629 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  32.14 
 
 		 1283 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>