194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3379 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  100 
 
 
354 aa  704    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  37.68 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  35.17 
 
 
342 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  36.52 
 
 
335 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  37.82 
 
 
336 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  33.57 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  33.93 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  31.09 
 
 
378 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  29.33 
 
 
367 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  34.49 
 
 
333 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  34.37 
 
 
355 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  31.22 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  31.74 
 
 
354 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  32.34 
 
 
383 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  34.11 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  32.87 
 
 
356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  31.41 
 
 
340 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  28.72 
 
 
351 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.52 
 
 
340 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  35.17 
 
 
384 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  32.56 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  33.99 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  31.23 
 
 
367 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  30.66 
 
 
342 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  32.34 
 
 
344 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  29.81 
 
 
356 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  31.45 
 
 
391 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  29.17 
 
 
354 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  31.58 
 
 
357 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  31.84 
 
 
354 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  30.37 
 
 
351 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  26.54 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  29.45 
 
 
335 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  30.73 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  29.35 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  30.77 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  31.15 
 
 
382 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  30.61 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  28.92 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  35.11 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  28.9 
 
 
356 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  30.25 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  29.87 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  28.81 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  32.03 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  27.91 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  28.73 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  28.73 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  32.08 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.46 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  31.02 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  25.77 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  28.37 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  27.75 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  26.67 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  31.65 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  30.94 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  33.74 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  24.27 
 
 
353 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  28.04 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  29.95 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  28.48 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  27.71 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  28.69 
 
 
691 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  27.25 
 
 
436 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  34.13 
 
 
406 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  27.07 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  30.36 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  30.39 
 
 
358 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  27.8 
 
 
420 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  27.99 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  30.59 
 
 
364 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  25.64 
 
 
362 aa  56.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  28.33 
 
 
358 aa  56.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  24.54 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5005  acyltransferase family protein  25.21 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  27.71 
 
 
675 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  24.94 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  26.99 
 
 
635 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  24.94 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  24.94 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  25.81 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.08 
 
 
639 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  26.53 
 
 
637 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  25.11 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3866  acyltransferase 3  25.3 
 
 
379 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  31.64 
 
 
508 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  29.27 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  28.76 
 
 
561 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  27.55 
 
 
658 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  34.68 
 
 
695 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.9 
 
 
667 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  29.55 
 
 
673 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  30.77 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  23.14 
 
 
584 aa  50.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  27.03 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  30.77 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  30.77 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  25.08 
 
 
437 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  27.1 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>