245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3376 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  56.9 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  57.69 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  48.39 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  48.76 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  53.66 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  55.38 
 
 		 135 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  57.02 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  47.33 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  57.02 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  57.02 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  53.54 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  59.66 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  44.53 
 
 		 157 aa  110  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  51.56 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  42.64 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  42.64 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  51.18 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  49.19 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  47.97 
 
 		 388 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  41.91 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  38.4 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  49.14 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2987  cytidine deaminase  48.48 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  41.27 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  45.99 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  42.75 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  49.18 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  41.09 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1797  cytidine deaminase  52.76 
 
 		 179 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  41.27 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  39.85 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  46.51 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  40.5 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  53.12 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  44.35 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  41.27 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  49.59 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.94 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.736977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  40.5 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  38.33 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  38.33 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  40.48 
 
 		 138 aa  95.9  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  40.83 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  40.62 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 129 aa  95.1  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 181 aa  95.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  48.44 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  46.09 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  48.09 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  46.09 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  46.09 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  49.53 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  44.78 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 135 aa  94.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  46.9 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  46.55 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  42.19 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  44.72 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  45.6 
 
 		 301 aa  94  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 132 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  44.72 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  46.96 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  36.43 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  39.67 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  44.09 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  48.78 
 
 		 199 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  40.65 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  46.96 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>