11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3375 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  100 
 
 		 432 aa  856    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1303  hypothetical protein  37.8 
 
 		 431 aa  239  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.424505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2080  O-antigen polymerase  26.41 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.473077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2125  O-antigen polymerase  26.02 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  29.41 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  28.92 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  21.38 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  27.44 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.22 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  24.6 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  21.58 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>