More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3361 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 454 aa  931    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  59.65 
 
 		 484 aa  544  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 		 578 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 1038 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 574 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  38.02 
 
 		 577 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  38.19 
 
 		 703 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 1450 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.03 
 
 		 760 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 		 608 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 542 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 1005 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 767 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 		 523 aa  245  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.38 
 
 		 1034 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  35.7 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 688 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1827 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.2 
 
 		 689 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.38 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 601 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 602 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 		 740 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 780 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 3145 aa  227  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.93 
 
 		 714 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 747 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 747 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 935 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 955 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  35.2 
 
 		 1677 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 714 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  35.34 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.75 
 
 		 620 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 662 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 556 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.95 
 
 		 653 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 653 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 611 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.87 
 
 		 1077 aa  209  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 620 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 646 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 615 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.36 
 
 		 649 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.36 
 
 		 649 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.39 
 
 		 615 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 527 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  34.15 
 
 		 648 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 558 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.68 
 
 		 1764 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  35.43 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 		 607 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 636 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  34.14 
 
 		 872 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  34.91 
 
 		 705 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.85 
 
 		 540 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.98 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.11 
 
 		 550 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 637 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  34.81 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1212 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 588 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  33.52 
 
 		 360 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.88 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 681 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  31.74 
 
 		 546 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  34.78 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.22 
 
 		 626 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  34.78 
 
 		 711 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 559 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 593 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  30.52 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 546 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 481 aa  167  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 545 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 583 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 592 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 614 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 614 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.19 
 
 		 603 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 595 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.27 
 
 		 626 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 571 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.5 
 
 		 626 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.5 
 
 		 614 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 614 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.5 
 
 		 614 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 636 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.15 
 
 		 733 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>