67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3357 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3357  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 348 aa  691    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00503474  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2685  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  57.47 
 
 		 319 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0125  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.22 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6573  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.4 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0431  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.19 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502544  hitchhiker  0.000000995003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3605  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.8 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.798177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0012  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  41.56 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0443  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.01 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0767  hypothetical protein  40.06 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1158  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  40.06 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3068  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.08 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  hitchhiker  0.00852886 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0010  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  40.62 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  40.62 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  40.06 
 
 		 401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1438  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  40.62 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.480301  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0013  succinylglutamate desuccinylase  40.62 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1517  succinylglutamate desuccinylase  40.06 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7599  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.06 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.596641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3449  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.32 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1484  hypothetical protein  42.04 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488665  hitchhiker  0.00120854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4061  hypothetical protein  39.32 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.775806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3406  hypothetical protein  39.32 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4700  hypothetical protein  40.51 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0821  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.59 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1077  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.09 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3619  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.86 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1675  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.99 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0681  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.51 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.281437  normal  0.0202656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3559  succinylglutamate desuccinylase  34.96 
 
 		 335 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52630  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4279  succinylglutamate desuccinylase  34.45 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3764  succinylglutamate desuccinylase  31.72 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168218  normal  0.0907041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2119  succinylglutamate desuccinylase  26.07 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.52 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4614  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257138  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2905  succinylglutamate desuccinylase  41.67 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.25 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1838  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.25 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1785  aspartoacylase  29.7 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.65 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2379  putative succinylglutamate desuccinylase  29.03 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0633  succinylglutamate desuccinylase  21.07 
 
 		 396 aa  46.2  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2462  succinylglutamate desuccinylase  26.6 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1888  succinylglutamate desuccinylase  26.6 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0217529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1934  succinylglutamate desuccinylase  23.58 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00118272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3980  succinylglutamate desuccinylase  30.65 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0691  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.73 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1966  succinylglutamate desuccinylase  26.87 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1447  succinylglutamate desuccinylase  26.6 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50451 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1827  succinylglutamate desuccinylase  26.6 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1898  succinylglutamate desuccinylase  26.6 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.22228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01701  hypothetical protein  26.6 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1990  succinylglutamate desuccinylase  26.6 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.920225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01713  succinylglutamate desuccinylase  26.6 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0100  deacylase-like  27.62 
 
 		 510 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4475  succinylglutamate desuccinylase  30.65 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4296  succinylglutamate desuccinylase  26.86 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2195  succinylglutamate desuccinylase  30 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1440  succinylglutamate desuccinylase  30.11 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  21.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1866  succinylglutamate desuccinylase  25.09 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.934682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  21.33 
 
 		 459 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  21.33 
 
 		 459 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  21.33 
 
 		 459 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  21.33 
 
 		 459 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2039  succinylglutamate desuccinylase  25 
 
 		 322 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>