284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3313 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 
141 aa  287  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  51.75 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.26 
 
 
159 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.26 
 
 
159 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.29 
 
 
149 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.69 
 
 
165 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.69 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.26 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.26 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  37.41 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  40.88 
 
 
163 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  37.31 
 
 
149 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  36.17 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.31 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  36.17 
 
 
162 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.67 
 
 
149 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  35.66 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  37.31 
 
 
160 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.32 
 
 
151 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  38.13 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.13 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  38.13 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  38.13 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  38.13 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.13 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.41 
 
 
163 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  35.21 
 
 
172 aa  84.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.48 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  34.29 
 
 
158 aa  84  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.29 
 
 
148 aa  84  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  32.03 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.12 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  34.01 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.5 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.05 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.8 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.81 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.27 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  32.61 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.08 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.08 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  34.75 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.56 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.5 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  38.02 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.78 
 
 
167 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.81 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.13 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.85 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.56 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.47 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  34.03 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.17 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  30.82 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.85 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  35.77 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  34.03 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.12 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  31.91 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.03 
 
 
171 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  31.65 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.64 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.65 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.65 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.61 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  32.37 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  31.85 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.93 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.28 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.43 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.28 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.17 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  34.56 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.01 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.66 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.33 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  33.57 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.17 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.43 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.21 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  31.65 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  33.1 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.54 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3078  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.64 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167444  normal  0.201859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.21 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.56 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.25 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.89 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>