More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3220 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  100 
 
 		 213 aa  411  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  50.6 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.5 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  47.96 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  45.86 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  45.86 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  40.2 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  40.38 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  40.67 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0201  ABC transporter related  38.92 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  38.42 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  47.19 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  37.99 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  37.99 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  37.99 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  37.91 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  37.91 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  39.68 
 
 		 253 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  37.23 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 224 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 224 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  36.61 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  41.9 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  36.61 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  36.31 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  39.67 
 
 		 253 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  38.38 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  34.76 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  41.27 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 		 253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  37.43 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4798  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5251  bacitracin export ATP-binding protein BceA  38.62 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0901  ABC transporter related  45.76 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.69974  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 		 253 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  42.05 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  40.32 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  42.42 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  37.43 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  38.59 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  36.31 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  39.15 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  40.32 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  39.33 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  37.78 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.344281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  37.91 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 250 aa  112  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  41.71 
 
 		 270 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  42.54 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.31 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  41.35 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  37.64 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1308  peptide ABC transporter ATPase  38.5 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000199498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  37.22 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  39.81 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 232 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 232 aa  111  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 255 aa  111  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  38.33 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 270 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 256 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  39.79 
 
 		 239 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 255 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  40.4 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  41.81 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  46.37 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  42.37 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  41.62 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  41.36 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  41.21 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  43.41 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>