More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3203 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  100 
 
 
361 aa  736    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  72.52 
 
 
345 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  64.56 
 
 
322 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  64.87 
 
 
321 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  63.61 
 
 
323 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  65.06 
 
 
314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  62.15 
 
 
334 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  61.32 
 
 
324 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  62.21 
 
 
321 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  61.32 
 
 
324 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  62.54 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  61.32 
 
 
324 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  63.58 
 
 
320 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  63.64 
 
 
321 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  63.96 
 
 
321 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  62.66 
 
 
314 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  60.31 
 
 
325 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  62.66 
 
 
321 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  60.06 
 
 
324 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  62.99 
 
 
321 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  62.34 
 
 
321 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  60.95 
 
 
324 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  61.56 
 
 
325 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  60.63 
 
 
324 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  61.06 
 
 
335 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  59.81 
 
 
318 aa  385  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  58.7 
 
 
338 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  61.56 
 
 
324 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  61.44 
 
 
326 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  61.25 
 
 
324 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  58.68 
 
 
312 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  58.31 
 
 
317 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  58.65 
 
 
326 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  58.57 
 
 
324 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  58.81 
 
 
331 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  57.63 
 
 
321 aa  374  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  58.68 
 
 
332 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  59.61 
 
 
326 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  55.38 
 
 
314 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  59.05 
 
 
314 aa  364  1e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  55.97 
 
 
335 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  58.28 
 
 
316 aa  362  7.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  56.48 
 
 
323 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  57.47 
 
 
311 aa  361  1e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  56.48 
 
 
323 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  54.95 
 
 
311 aa  361  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  57.96 
 
 
316 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  56.21 
 
 
317 aa  359  5e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  58.15 
 
 
317 aa  358  8e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  61.25 
 
 
324 aa  358  8e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  55.69 
 
 
318 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  56.53 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  56.96 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  54.13 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  54.13 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  56.23 
 
 
346 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  56.62 
 
 
320 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  56.31 
 
 
320 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  56.31 
 
 
320 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  56.31 
 
 
320 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0755  thioredoxin reductase  60.32 
 
 
315 aa  354  2e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  56 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  56 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  56 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  56 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  56 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  56.31 
 
 
320 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  56 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  56 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  57.14 
 
 
319 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  55.14 
 
 
320 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.22 
 
 
311 aa  352  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  55.8 
 
 
321 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  55.69 
 
 
320 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  57.45 
 
 
316 aa  348  8e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  56.03 
 
 
314 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  56.03 
 
 
314 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  54.95 
 
 
311 aa  345  5e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  56.37 
 
 
316 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  57.01 
 
 
333 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  53.99 
 
 
342 aa  344  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  55.9 
 
 
316 aa  344  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  56.37 
 
 
316 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  55.73 
 
 
352 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  56.69 
 
 
316 aa  342  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  55.76 
 
 
333 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  55.83 
 
 
318 aa  342  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  52.45 
 
 
319 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  52.73 
 
 
310 aa  342  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  58.06 
 
 
338 aa  342  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  52.8 
 
 
317 aa  342  7e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  55.28 
 
 
317 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  54.49 
 
 
334 aa  341  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  54.55 
 
 
311 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  55.9 
 
 
317 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  55.97 
 
 
320 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  54.35 
 
 
314 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  52.19 
 
 
314 aa  339  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  52.8 
 
 
317 aa  339  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  55.35 
 
 
321 aa  338  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>