More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3194 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 
428 aa  839    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.82 
 
 
495 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.25 
 
 
480 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  35.19 
 
 
496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  36.34 
 
 
477 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.53 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.15 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.11 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.15 
 
 
493 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.56 
 
 
476 aa  212  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.03 
 
 
225 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.85 
 
 
484 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.23 
 
 
484 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.7 
 
 
485 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.36 
 
 
220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.52 
 
 
493 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.23 
 
 
217 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.7 
 
 
209 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0522  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.54 
 
 
208 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078684 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  32.49 
 
 
492 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.76 
 
 
260 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.05 
 
 
224 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.06 
 
 
202 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.12 
 
 
224 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3335  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.08 
 
 
211 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0920628 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48 
 
 
213 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.5 
 
 
213 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  51.89 
 
 
474 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.6 
 
 
491 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  53.65 
 
 
211 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.83 
 
 
213 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.38 
 
 
485 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.98 
 
 
237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  46.7 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0118  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.02 
 
 
217 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.69 
 
 
206 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.04 
 
 
217 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.63 
 
 
224 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.36 
 
 
216 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.56 
 
 
485 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4300  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.15 
 
 
207 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.24 
 
 
230 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.24 
 
 
230 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.58 
 
 
229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.09 
 
 
223 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.24 
 
 
229 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.37 
 
 
479 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  48.89 
 
 
218 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.56 
 
 
207 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  48.89 
 
 
218 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  48.89 
 
 
218 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.74 
 
 
223 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.74 
 
 
223 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.73 
 
 
217 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.7 
 
 
217 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.22 
 
 
223 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3623  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.91 
 
 
216 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8784  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.14 
 
 
222 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.17 
 
 
244 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.33 
 
 
465 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.73 
 
 
219 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.8 
 
 
214 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  38.05 
 
 
255 aa  128  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.33 
 
 
546 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.68 
 
 
217 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.04 
 
 
210 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.23 
 
 
205 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.76 
 
 
216 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.26 
 
 
206 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.98 
 
 
205 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.28 
 
 
203 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  36.97 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.57 
 
 
290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.66 
 
 
199 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.07 
 
 
209 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.56 
 
 
245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  42.17 
 
 
507 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.97 
 
 
414 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.58 
 
 
315 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.9 
 
 
401 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  32.95 
 
 
200 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.65 
 
 
186 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.69 
 
 
294 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.45 
 
 
264 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.57 
 
 
189 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.47 
 
 
187 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  37.64 
 
 
261 aa  108  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.66 
 
 
200 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.91 
 
 
201 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.51 
 
 
273 aa  107  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.84 
 
 
342 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.84 
 
 
346 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.84 
 
 
346 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.37 
 
 
202 aa  108  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  38.3 
 
 
292 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  32.52 
 
 
200 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.41 
 
 
304 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0074  uracil-DNA glycosylase  38.89 
 
 
261 aa  107  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  36.96 
 
 
233 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>