More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3187 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  100 
 
 		 350 aa  704    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  84.42 
 
 		 332 aa  524  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  64.69 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  63.98 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  68.11 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  64.95 
 
 		 391 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  67.8 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  64.49 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  67.18 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  67.31 
 
 		 351 aa  411  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  63.56 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  64.58 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.44 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.28 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.28 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.09 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  62.29 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.47 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  64.04 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.78 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  63.72 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.7 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  60.73 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  63.74 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  63.74 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  60.57 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  61.21 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  63.12 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  63.2 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.55 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  61.7 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  60.53 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  61.92 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  61.7 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.86 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.86 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  63.14 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  59.24 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  58.94 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  60.73 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  58.95 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  56.16 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 346 aa  318  9e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  53.56 
 
 		 343 aa  317  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  52.32 
 
 		 329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  52.32 
 
 		 329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.56 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  52.65 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  48.69 
 
 		 340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.6 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.47 
 
 		 426 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.89 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.04 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  49.51 
 
 		 340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  46.31 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  51.62 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  52.37 
 
 		 345 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  50 
 
 		 347 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 379 aa  299  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.28 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  56.06 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  52.07 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  47.59 
 
 		 440 aa  295  7e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.97 
 
 		 362 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  49.43 
 
 		 405 aa  295  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  49.57 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.2 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 406 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  52.65 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  51.89 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  48.09 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  51.48 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  49.25 
 
 		 407 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.14 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.82 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.05 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  48.84 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.7 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  48.84 
 
 		 346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  47.8 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  52.76 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 370 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 338 aa  289  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.39 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  52.45 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0444  GTPase ObgE  45.87 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>