More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3040 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 188 aa  367  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  69.19 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  60.62 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  59.52 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  54.69 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  54.69 
 
 		 189 aa  204  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  54.17 
 
 		 189 aa  204  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  62.5 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  62.5 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  61.25 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  61.25 
 
 		 190 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  60.62 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  60.62 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  58.18 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  58.75 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  58.18 
 
 		 189 aa  194  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  58.75 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  60.62 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  56.88 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  56.25 
 
 		 191 aa  188  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  62.66 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  61.73 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  54.37 
 
 		 191 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  56.25 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  56.88 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  57.5 
 
 		 204 aa  180  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  53.75 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  53.75 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  52.6 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  52 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  52.5 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  52.5 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  51.81 
 
 		 197 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  58.9 
 
 		 195 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 		 202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  50.86 
 
 		 202 aa  170  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  50.6 
 
 		 196 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  50.6 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  54.66 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  51.03 
 
 		 150 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  49.65 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  48.97 
 
 		 149 aa  131  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  46.67 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 		 147 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  46.21 
 
 		 148 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  50.74 
 
 		 148 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  46.67 
 
 		 150 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  46.9 
 
 		 149 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  45.33 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 149 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 147 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 147 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  47.06 
 
 		 150 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 149 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4874  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 148 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4755  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 148 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 150 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  47.26 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 148 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 149 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 149 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 149 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0783  50S ribosomal protein L9  42.51 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 150 aa  117  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>