240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3023 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 516 aa  1050    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  66.27 
 
 		 504 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  66.27 
 
 		 504 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  66.87 
 
 		 504 aa  674    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  65.67 
 
 		 505 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  63.8 
 
 		 512 aa  623  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  57.62 
 
 		 523 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  56.75 
 
 		 504 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  57.49 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  55.29 
 
 		 506 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  55.69 
 
 		 506 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  55.69 
 
 		 506 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  52.07 
 
 		 511 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  55.38 
 
 		 510 aa  511  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 525 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  51.48 
 
 		 511 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 		 514 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  52.76 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  54.29 
 
 		 507 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 		 517 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  50.79 
 
 		 508 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 		 518 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.93 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 		 515 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 509 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  54.27 
 
 		 506 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  52.08 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 519 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  50.1 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  495  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  50.2 
 
 		 514 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  48.14 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 		 513 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 521 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  52.03 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 		 512 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 512 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  52.69 
 
 		 525 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  48.96 
 
 		 552 aa  487  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 511 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 		 511 aa  485  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  48.34 
 
 		 514 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0868  phosphoglyceromutase  48.91 
 
 		 506 aa  485  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  51.97 
 
 		 521 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 		 514 aa  485  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  49.24 
 
 		 530 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  53.12 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 517 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  50.5 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  47.45 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  49.81 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  49.03 
 
 		 542 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  49.31 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  49.7 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  47.06 
 
 		 509 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 		 529 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  47.24 
 
 		 511 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 		 512 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  50 
 
 		 532 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  47.06 
 
 		 509 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  48.46 
 
 		 514 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>