More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3021 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
472 aa  954    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  48.3 
 
 
457 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  52.79 
 
 
444 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  55.43 
 
 
440 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  55.43 
 
 
440 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  49.88 
 
 
440 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  53.67 
 
 
471 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  53.33 
 
 
440 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  49.74 
 
 
441 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  49.51 
 
 
447 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  52.65 
 
 
423 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  53.07 
 
 
440 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  52.41 
 
 
445 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  52.53 
 
 
440 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  52.53 
 
 
440 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  52.53 
 
 
440 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  47.2 
 
 
444 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  53.57 
 
 
458 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  51.32 
 
 
446 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  46.05 
 
 
424 aa  362  8e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  54.38 
 
 
451 aa  362  8e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  53.13 
 
 
445 aa  362  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  46.28 
 
 
424 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  43.55 
 
 
442 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  53.61 
 
 
456 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  53.59 
 
 
457 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  50 
 
 
451 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  45.14 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  52.13 
 
 
444 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  45.51 
 
 
468 aa  355  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  47.67 
 
 
446 aa  355  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  47.88 
 
 
438 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  48.61 
 
 
448 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  52.99 
 
 
452 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  48.61 
 
 
448 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  46.34 
 
 
453 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  53.61 
 
 
440 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  45.35 
 
 
434 aa  351  1e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  51.12 
 
 
439 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  49.86 
 
 
481 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  49.45 
 
 
445 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  42.49 
 
 
482 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  42.49 
 
 
482 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  46.65 
 
 
436 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  44.18 
 
 
461 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  47.98 
 
 
449 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  44.44 
 
 
476 aa  347  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  50 
 
 
436 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  46.12 
 
 
439 aa  346  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  50 
 
 
439 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  43.95 
 
 
441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  49.87 
 
 
443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  46.94 
 
 
438 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  46.94 
 
 
438 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  46.7 
 
 
438 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.96 
 
 
452 aa  342  8e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  44.8 
 
 
463 aa  342  9e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  45.5 
 
 
432 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  45.72 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  45.07 
 
 
443 aa  336  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  44.28 
 
 
455 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  46.58 
 
 
439 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  43.22 
 
 
480 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  46.15 
 
 
441 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  47.84 
 
 
444 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  44.78 
 
 
445 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  46.27 
 
 
445 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  46.27 
 
 
445 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  44.01 
 
 
437 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  44.53 
 
 
435 aa  329  7e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  44.78 
 
 
445 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  47.79 
 
 
483 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  49.26 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  42.28 
 
 
428 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  43.47 
 
 
462 aa  325  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  44.32 
 
 
446 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  44.33 
 
 
434 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  46.56 
 
 
468 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  47.55 
 
 
438 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  46.83 
 
 
444 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  43.56 
 
 
449 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  47.09 
 
 
444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  45.65 
 
 
462 aa  319  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  41.8 
 
 
444 aa  319  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  45.68 
 
 
530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  47.61 
 
 
526 aa  312  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  47.34 
 
 
522 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  47.84 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  43.35 
 
 
439 aa  310  4e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  45.81 
 
 
524 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  45.81 
 
 
524 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  45.81 
 
 
524 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  45.81 
 
 
524 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  45.81 
 
 
530 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  45.81 
 
 
530 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  45.81 
 
 
521 aa  308  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  45.81 
 
 
524 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  43.73 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  42.36 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  44.2 
 
 
515 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>