More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3007 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  100 
 
 		 224 aa  443  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  63.32 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0639  ribonuclease H  63.92 
 
 		 199 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000711247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  57.14 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  52.97 
 
 		 199 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  52 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  54.79 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  51.23 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  51.23 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  48.86 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  49.49 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 202 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 202 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  50.98 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  42.36 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 211 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.06 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.98 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  52.13 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  52.58 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  50.79 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  50.51 
 
 		 198 aa  158  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  43 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.27 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  49.19 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  49.21 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  46.96 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  48.69 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  53.55 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 213 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  48.94 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  43.35 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  50.81 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  44.74 
 
 		 201 aa  152  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0799  RNase HII  54.84 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  48.45 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  45.65 
 
 		 221 aa  151  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.13 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  45.32 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1266  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  48.68 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  48.47 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  50 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  46.74 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 198 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0701  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 195 aa  148  8e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 258 aa  147  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  41.15 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  41.38 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>