178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2937 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  100 
 
 
138 aa  284  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  81.34 
 
 
137 aa  225  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  65.44 
 
 
137 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  64.71 
 
 
137 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  61.76 
 
 
137 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  63.24 
 
 
137 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  63.97 
 
 
137 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  63.24 
 
 
137 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  61.76 
 
 
137 aa  184  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  61.15 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  61.76 
 
 
137 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  58.82 
 
 
163 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  60.29 
 
 
137 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  59.42 
 
 
138 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  59.42 
 
 
139 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  58.7 
 
 
140 aa  165  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  58.7 
 
 
140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  56.83 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  55.88 
 
 
137 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  55.15 
 
 
141 aa  158  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  53.68 
 
 
142 aa  157  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  55.88 
 
 
137 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  61.07 
 
 
141 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  54.81 
 
 
144 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  53.68 
 
 
142 aa  153  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  53.68 
 
 
142 aa  153  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  54.41 
 
 
139 aa  153  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  55.97 
 
 
135 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  55.88 
 
 
137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  52.94 
 
 
144 aa  147  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  52.21 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  48.89 
 
 
140 aa  145  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  52.55 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  53.28 
 
 
143 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  143  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  50.38 
 
 
138 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  51.82 
 
 
143 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  51.82 
 
 
143 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  53.03 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  52.63 
 
 
154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  54.55 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  51.52 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  50.38 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  52.27 
 
 
146 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  47.37 
 
 
137 aa  135  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  45.04 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  46.32 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  49.61 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  45.52 
 
 
147 aa  123  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  45.45 
 
 
142 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  47.33 
 
 
138 aa  120  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  45.7 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  44.44 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  38.35 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  44.37 
 
 
158 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  45.86 
 
 
148 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  40.79 
 
 
152 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  40 
 
 
173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  44.22 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  44.08 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  40.13 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  43.51 
 
 
156 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  39.86 
 
 
152 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  37.59 
 
 
135 aa  105  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  42.11 
 
 
156 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  41.33 
 
 
152 aa  103  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  41.89 
 
 
155 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  44.52 
 
 
153 aa  103  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  44.52 
 
 
153 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  43.42 
 
 
152 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  38.06 
 
 
135 aa  102  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  43.84 
 
 
153 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  43.84 
 
 
153 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  42.28 
 
 
158 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  41.83 
 
 
154 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  36 
 
 
150 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  41.1 
 
 
155 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  38 
 
 
156 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  36 
 
 
150 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  43.15 
 
 
153 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0781  protein of unknown function DUF55  42.86 
 
 
154 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0209669  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  42.57 
 
 
149 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  42.76 
 
 
165 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  42.66 
 
 
153 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  40.13 
 
 
154 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  40.54 
 
 
155 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  41.96 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  40.14 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  45.21 
 
 
153 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  45.21 
 
 
153 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  38.16 
 
 
154 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  45.89 
 
 
153 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  45.21 
 
 
153 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  39.86 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  39.47 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  38.67 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  41.89 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>