More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2883 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  71.63 
 
 
767 aa  1059    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  100 
 
 
741 aa  1472    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  55.01 
 
 
742 aa  803    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  72.55 
 
 
770 aa  1081    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.16 
 
 
736 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  43 
 
 
744 aa  569  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  43.62 
 
 
744 aa  561  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  42.98 
 
 
714 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  42.56 
 
 
714 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  42.21 
 
 
740 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  38.95 
 
 
724 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  38.67 
 
 
724 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  38.42 
 
 
741 aa  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  38.32 
 
 
739 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  32.31 
 
 
700 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  36.04 
 
 
724 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  36.04 
 
 
724 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  34.88 
 
 
731 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  36.45 
 
 
705 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  35.42 
 
 
728 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  33.51 
 
 
721 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  33.2 
 
 
725 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  37.61 
 
 
720 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  37.79 
 
 
726 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  37.21 
 
 
728 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  33.38 
 
 
706 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
720 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  37.34 
 
 
753 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  37.12 
 
 
720 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  32.07 
 
 
699 aa  368  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  37.91 
 
 
739 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  35.5 
 
 
712 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  36.63 
 
 
865 aa  359  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.71 
 
 
720 aa  357  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  35.39 
 
 
743 aa  357  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  34.39 
 
 
750 aa  355  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  34.54 
 
 
892 aa  354  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.35 
 
 
717 aa  353  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.24 
 
 
1000 aa  352  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  35.84 
 
 
726 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  36.01 
 
 
719 aa  348  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  34.38 
 
 
731 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.79 
 
 
1024 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  35.63 
 
 
714 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  34.6 
 
 
906 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  34.44 
 
 
906 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  34.11 
 
 
712 aa  337  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  34.11 
 
 
712 aa  336  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.38 
 
 
1003 aa  333  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  33.95 
 
 
712 aa  332  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.28 
 
 
1013 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.11 
 
 
971 aa  328  3e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.81 
 
 
908 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  35.61 
 
 
908 aa  328  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  30.93 
 
 
930 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.18 
 
 
1001 aa  323  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  33.84 
 
 
1038 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  33.17 
 
 
975 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  35.79 
 
 
1038 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.18 
 
 
1019 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  28.25 
 
 
968 aa  320  7e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.39 
 
 
976 aa  320  7.999999999999999e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.22 
 
 
1008 aa  320  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.22 
 
 
1008 aa  320  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  31.98 
 
 
986 aa  319  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  32.91 
 
 
715 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.82 
 
 
715 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.77 
 
 
999 aa  316  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.53 
 
 
1013 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.78 
 
 
1012 aa  313  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.94 
 
 
1016 aa  310  5e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  37.19 
 
 
523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.55 
 
 
1040 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  35.42 
 
 
1011 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  33.44 
 
 
1042 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.95 
 
 
1006 aa  299  1e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  28.17 
 
 
762 aa  298  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  30.28 
 
 
980 aa  296  9e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.75 
 
 
1018 aa  293  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.75 
 
 
1018 aa  293  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  30.73 
 
 
737 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  33.13 
 
 
731 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  30.85 
 
 
730 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  32.82 
 
 
733 aa  290  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  28.04 
 
 
721 aa  290  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  30.12 
 
 
982 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  31.76 
 
 
740 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.32 
 
 
1018 aa  287  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.98 
 
 
731 aa  286  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  31.15 
 
 
730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.61 
 
 
759 aa  280  7e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  27.58 
 
 
718 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  40.5 
 
 
368 aa  279  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  28.57 
 
 
738 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  27.58 
 
 
718 aa  278  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.82 
 
 
727 aa  278  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  27.65 
 
 
704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  28.55 
 
 
734 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  29.19 
 
 
704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  29.67 
 
 
727 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>