More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2881 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  51.31 
 
 		 1169 aa  1107    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  47.86 
 
 		 1151 aa  972    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  40.66 
 
 		 1189 aa  818    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.95 
 
 		 1132 aa  751    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  44.63 
 
 		 1191 aa  1021    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.75 
 
 		 1132 aa  741    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.92 
 
 		 1133 aa  748    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.83 
 
 		 1133 aa  745    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  41.08 
 
 		 1136 aa  801    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  41.41 
 
 		 1191 aa  958    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  40.22 
 
 		 1169 aa  816    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  50.72 
 
 		 1158 aa  1116    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  42.46 
 
 		 1182 aa  975    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  43.36 
 
 		 1188 aa  1009    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  47.75 
 
 		 1215 aa  1051    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  39.02 
 
 		 1136 aa  770    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  48.99 
 
 		 1178 aa  1061    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  45.36 
 
 		 1178 aa  994    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  81.56 
 
 		 1171 aa  1930    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  49.63 
 
 		 1176 aa  1048    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  41.31 
 
 		 1180 aa  837    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.4 
 
 		 1132 aa  751    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.75 
 
 		 1132 aa  742    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  40.28 
 
 		 1254 aa  823    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  48.86 
 
 		 1157 aa  1095    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  47.39 
 
 		 1208 aa  1011    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  48.71 
 
 		 1199 aa  1017    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  48.2 
 
 		 1208 aa  1045    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  42.54 
 
 		 1149 aa  780    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  40.65 
 
 		 1208 aa  829    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  37.9 
 
 		 1132 aa  744    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.75 
 
 		 1132 aa  741    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.33 
 
 		 1163 aa  925    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  43.36 
 
 		 1188 aa  1011    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  47.06 
 
 		 1190 aa  1010    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  47.68 
 
 		 1223 aa  1067    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  66.1 
 
 		 1182 aa  1538    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  47.96 
 
 		 1181 aa  999    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  42.93 
 
 		 1150 aa  806    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  44.6 
 
 		 1191 aa  1025    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  42.85 
 
 		 1150 aa  794    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  43.42 
 
 		 1188 aa  993    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  42.71 
 
 		 1187 aa  1002    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  40.93 
 
 		 1156 aa  915    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  45.03 
 
 		 1176 aa  1003    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  48.54 
 
 		 1173 aa  1049    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  38.07 
 
 		 1132 aa  749    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  49.29 
 
 		 1171 aa  1055    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  50.72 
 
 		 1154 aa  1113    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  49.21 
 
 		 1192 aa  1056    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  49.29 
 
 		 1195 aa  1038    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  42.63 
 
 		 1182 aa  976    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  45.54 
 
 		 1197 aa  1016    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  44.03 
 
 		 1224 aa  975    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  43.1 
 
 		 1150 aa  800    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  48.74 
 
 		 1156 aa  1056    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  45.67 
 
 		 1212 aa  1009    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  48.75 
 
 		 1184 aa  1040    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  41.04 
 
 		 1196 aa  821    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  48.82 
 
 		 1167 aa  1043    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  48.24 
 
 		 1216 aa  1007    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  50.51 
 
 		 1154 aa  1117    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  48.15 
 
 		 1214 aa  1008    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  46.96 
 
 		 1183 aa  1057    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  49.87 
 
 		 1158 aa  1080    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.09 
 
 		 1132 aa  750    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  100 
 
 		 1168 aa  2384    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  48.71 
 
 		 1193 aa  1012    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.68 
 
 		 1132 aa  745    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  44.91 
 
 		 1214 aa  1003    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  34.15 
 
 		 1266 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  35.43 
 
 		 1247 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  33.96 
 
 		 1245 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  33.14 
 
 		 1246 aa  586  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  34.4 
 
 		 1248 aa  588  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  34.3 
 
 		 1250 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  34 
 
 		 1250 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  31.39 
 
 		 1261 aa  583  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  33.66 
 
 		 1264 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  31.08 
 
 		 1274 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  34.08 
 
 		 1250 aa  581  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  34.16 
 
 		 1250 aa  582  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.92 
 
 		 1226 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  33.74 
 
 		 1237 aa  576  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  33.09 
 
 		 1257 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  33.66 
 
 		 1261 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  32.76 
 
 		 1257 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  33.25 
 
 		 1245 aa  572  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  33.74 
 
 		 1261 aa  570  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  33.22 
 
 		 1257 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  33.91 
 
 		 1257 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  31.92 
 
 		 1226 aa  568  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  32.23 
 
 		 1209 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  32.87 
 
 		 1234 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  32.45 
 
 		 1278 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  32.16 
 
 		 1227 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  32.13 
 
 		 1262 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  32.08 
 
 		 1227 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  32.98 
 
 		 1263 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  33.89 
 
 		 1226 aa  563  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>