175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2875 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  66.06 
 
 
1285 aa  820  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
1848 aa  3377  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  36.58 
 
 
2396 aa  455  1e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  36.33 
 
 
2365 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  36.12 
 
 
2346 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  38.37 
 
 
2366 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  1.66918e-09 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.61 
 
 
1508 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  37.29 
 
 
995 aa  373  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  33.61 
 
 
1119 aa  363  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  35.82 
 
 
986 aa  357  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.7 
 
 
1227 aa  357  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.77 
 
 
1029 aa  339  3e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  34.81 
 
 
2371 aa  331  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.37 
 
 
1881 aa  323  2e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
1782 aa  317  1e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  31.06 
 
 
2003 aa  313  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  35.06 
 
 
3822 aa  312  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  35.2 
 
 
4238 aa  311  1e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  33.23 
 
 
3506 aa  303  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  34.56 
 
 
4238 aa  285  4e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  32.79 
 
 
3954 aa  283  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  31.51 
 
 
990 aa  280  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.81 
 
 
1011 aa  274  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  39.37 
 
 
1056 aa  263  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.76 
 
 
972 aa  259  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  30.85 
 
 
1519 aa  254  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.08 
 
 
919 aa  253  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  32.47 
 
 
1164 aa  252  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  33.22 
 
 
1055 aa  250  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  33.94 
 
 
1038 aa  246  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  34.21 
 
 
1006 aa  239  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  32.86 
 
 
991 aa  237  2e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  32.45 
 
 
1001 aa  234  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  36.42 
 
 
1062 aa  233  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  32.11 
 
 
1004 aa  232  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  33.84 
 
 
1028 aa  232  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  3.68637e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  31.88 
 
 
1033 aa  230  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  35.95 
 
 
1053 aa  229  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  32.26 
 
 
1001 aa  229  5e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  30.88 
 
 
2711 aa  228  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.79 
 
 
1125 aa  228  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  32.69 
 
 
995 aa  224  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  32.09 
 
 
983 aa  219  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  32.76 
 
 
994 aa  218  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  31.58 
 
 
2407 aa  216  3e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.01 
 
 
677 aa  215  8e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  40.64 
 
 
1458 aa  213  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  31.52 
 
 
650 aa  209  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  32.43 
 
 
980 aa  209  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  31.61 
 
 
985 aa  206  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  30.92 
 
 
1333 aa  205  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  40.77 
 
 
1459 aa  204  2e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  30.6 
 
 
1130 aa  187  2e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  35.1 
 
 
2578 aa  185  8e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  30.69 
 
 
1131 aa  180  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  30.69 
 
 
1129 aa  180  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  29.76 
 
 
1152 aa  179  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  30.54 
 
 
1129 aa  178  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  30.54 
 
 
1131 aa  178  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  30.54 
 
 
1131 aa  178  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  30.54 
 
 
1131 aa  178  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  32.81 
 
 
1016 aa  176  4e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  33.69 
 
 
1971 aa  176  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  30.69 
 
 
1131 aa  173  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.75 
 
 
3629 aa  167  2e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  30.84 
 
 
1011 aa  154  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  32.19 
 
 
2906 aa  153  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.19 
 
 
1532 aa  151  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.34 
 
 
1694 aa  150  2e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  35.41 
 
 
1172 aa  149  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31 
 
 
3322 aa  145  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.27 
 
 
1322 aa  141  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  6.38249e-09 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  33.76 
 
 
1530 aa  139  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.41 
 
 
1741 aa  124  2e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  30.43 
 
 
816 aa  119  8e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  27.9 
 
 
1111 aa  114  2e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  31.54 
 
 
1130 aa  111  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  30.99 
 
 
488 aa  110  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  27.21 
 
 
882 aa  102  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  38.89 
 
 
1180 aa  101  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  31.98 
 
 
1882 aa  100  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.09 
 
 
3089 aa  97.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.14 
 
 
2057 aa  96.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  26.88 
 
 
1019 aa  90.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  34.43 
 
 
1113 aa  90.1  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.21 
 
 
915 aa  87.8  2e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  26.55 
 
 
407 aa  87.8  2e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  26.68 
 
 
814 aa  86.7  3e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  28.94 
 
 
994 aa  85.9  8e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.07 
 
 
3391 aa  84  2e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  25.76 
 
 
1078 aa  84.3  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.06 
 
 
2363 aa  81.3  1e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  33.07 
 
 
2642 aa  81.6  1e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.95 
 
 
926 aa  81.3  2e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  36.02 
 
 
2926 aa  78.2  1e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.75 
 
 
910 aa  77.4  3e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.02 
 
 
913 aa  77.4  3e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  28.15 
 
 
311 aa  76.3  6e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.8 
 
 
1357 aa  75.9  7e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  31.76 
 
 
987 aa  73.9  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>