23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2822 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  100 
 
 
146 aa  294  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  75.74 
 
 
172 aa  218  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  67.59 
 
 
153 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  36.23 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  38.79 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  43.12 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  33.83 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  37.17 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  33.58 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  34.35 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  36.3 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  31.54 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  29.01 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  31.78 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  30.89 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  26.15 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  29.27 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  28.26 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  28.89 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  31.09 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>