More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2804 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 238 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  59.09 
 
 		 310 aa  260  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  57.89 
 
 		 257 aa  244  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  55.88 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  57.92 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  61.06 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  52.94 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  57.51 
 
 		 197 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  52.89 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  53.54 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  51.46 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  53.2 
 
 		 268 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  50.45 
 
 		 301 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  53.52 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  52.27 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  51.09 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  48.22 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 254 aa  191  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  56.52 
 
 		 231 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  51.13 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  54.22 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  60.84 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  51.12 
 
 		 300 aa  188  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  54.4 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  54.4 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  48.31 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  53.8 
 
 		 338 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  57.99 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  50.46 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  48.84 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  54.67 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  48.26 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  53.96 
 
 		 460 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 		 484 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  64 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  49.69 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  55.47 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  51.02 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  65.59 
 
 		 120 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  50.82 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  43.29 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  41.6 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  46.03 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  45.6 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.06 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.74 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  45.69 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  39.06 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  46.61 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  41.98 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  45.9 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  44.07 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.2 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  39.2 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  39.42 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  43.85 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.13 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  48 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  39.2 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  43.09 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  48.42 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.5 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4565  lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 314 aa  75.1  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0155983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.23 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  38.67 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  43.56 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  41.41 
 
 		 146 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  42.31 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  41.13 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  35.88 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  42.15 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  43.31 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  43 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  33.56 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  42.5 
 
 		 326 aa  72  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  36.51 
 
 		 204 aa  72  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  36.64 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  40.18 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  39.73 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>