More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2799 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
212 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  85.85 
 
 
212 aa  363  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.83 
 
 
217 aa  358  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  83.96 
 
 
212 aa  354  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  85.78 
 
 
217 aa  354  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  83.41 
 
 
217 aa  353  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  83.41 
 
 
220 aa  351  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.08 
 
 
212 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.43 
 
 
212 aa  343  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  80.95 
 
 
217 aa  340  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  80.95 
 
 
217 aa  340  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  80.48 
 
 
217 aa  338  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.84 
 
 
217 aa  338  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  87.37 
 
 
217 aa  334  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  85.05 
 
 
217 aa  332  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  78.77 
 
 
212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.88 
 
 
276 aa  283  9e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.64 
 
 
212 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.11 
 
 
212 aa  258  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.21 
 
 
212 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.55 
 
 
212 aa  247  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  64.59 
 
 
212 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.11 
 
 
212 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.11 
 
 
212 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.11 
 
 
212 aa  245  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  65.07 
 
 
212 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.59 
 
 
212 aa  245  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.59 
 
 
212 aa  244  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.21 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.16 
 
 
212 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.07 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.11 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.11 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.07 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.07 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.59 
 
 
212 aa  240  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  62.68 
 
 
212 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.89 
 
 
212 aa  225  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  53.62 
 
 
207 aa  225  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.74 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.9 
 
 
207 aa  210  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.47 
 
 
214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.76 
 
 
222 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.53 
 
 
209 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.29 
 
 
209 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  42.58 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.83 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.76 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.15 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  34.25 
 
 
220 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.79 
 
 
220 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.79 
 
 
220 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  37.74 
 
 
218 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.79 
 
 
220 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
220 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.05 
 
 
212 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
220 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  34.25 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  34.25 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  34.25 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  34.25 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  33.33 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  34.25 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  34.25 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  34.25 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
220 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.89 
 
 
210 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.74 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.74 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.11 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  40 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  36.15 
 
 
222 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.76 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.67 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.91 
 
 
216 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.38 
 
 
209 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  40.1 
 
 
211 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.1 
 
 
211 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  35.05 
 
 
211 aa  99  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.7 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.33 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  30.62 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.79 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.3 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.67 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.31 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  34.88 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.96 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.56 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  33.17 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>