More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2696 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2696  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  61.16 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60.42 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  57.68 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  58.09 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  58.09 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  58.09 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  58.09 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 252 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  59.41 
 
 		 254 aa  307  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  56.85 
 
 		 253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  57.26 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  57.92 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  56.85 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  57.92 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  57.92 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  57.92 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.44 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  57.02 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  57.26 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  57.5 
 
 		 254 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 269 aa  301  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  59.41 
 
 		 250 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  58.16 
 
 		 273 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  56.07 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  56.02 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 249 aa  299  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  59 
 
 		 273 aa  299  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  57.02 
 
 		 249 aa  299  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  55.65 
 
 		 257 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  56.25 
 
 		 254 aa  296  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  54.96 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  55.6 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  55.65 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  58.75 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  55 
 
 		 254 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  57.74 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  56.02 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  57.32 
 
 		 251 aa  295  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  57.92 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  54.81 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  54.36 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  54.36 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  56.6 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 254 aa  294  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  56.07 
 
 		 267 aa  293  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  56.2 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  54.81 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  56.91 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  54.81 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  57.08 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  57.85 
 
 		 257 aa  291  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3584  ABC transporter related  54.55 
 
 		 255 aa  291  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  0.0302261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  60.17 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  55.19 
 
 		 266 aa  291  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  55.79 
 
 		 248 aa  291  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 242 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  55.79 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  55.56 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  55.42 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  55 
 
 		 246 aa  290  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4870  ABC transporter related  58.3 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  53.31 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 260 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  55.42 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.31 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  56.85 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  55.6 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  55.37 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  55.19 
 
 		 254 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  54.58 
 
 		 242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  53.72 
 
 		 261 aa  288  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  54.17 
 
 		 242 aa  287  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  53.75 
 
 		 242 aa  286  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4182  ABC transporter related protein  53.53 
 
 		 261 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  54.58 
 
 		 260 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.67 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  55.79 
 
 		 265 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  56.07 
 
 		 252 aa  284  9e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  55 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.75 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  54.17 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  53.91 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  54.32 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  53.69 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  56.2 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.31 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>