More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2655 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  72.47 
 
 		 774 aa  1156    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  69.99 
 
 		 774 aa  1129    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  100 
 
 		 771 aa  1550    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  26.68 
 
 		 674 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  32.87 
 
 		 679 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  30.67 
 
 		 946 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  30.09 
 
 		 722 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  28.3 
 
 		 720 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  29.52 
 
 		 756 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  33 
 
 		 738 aa  97.8  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  23.44 
 
 		 796 aa  94.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  30.22 
 
 		 719 aa  90.5  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  24.17 
 
 		 723 aa  87.8  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  35.66 
 
 		 989 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  38.52 
 
 		 997 aa  79.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  24.39 
 
 		 783 aa  79.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  27.2 
 
 		 773 aa  78.2  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  26.99 
 
 		 684 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  29.58 
 
 		 987 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 933 aa  61.6  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 652 aa  60.1  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 472 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  24.29 
 
 		 587 aa  60.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  32.03 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.853627  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  26.22 
 
 		 971 aa  58.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  32.38 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 897 aa  57.4  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 522 aa  57  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  0.0594236 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 1325 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  39.47 
 
 		 418 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  25.91 
 
 		 662 aa  57.4  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 963 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  35.38 
 
 		 427 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  37.25 
 
 		 482 aa  56.6  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 592 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  34.32 
 
 		 376 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.401412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 753 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 487 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  32.99 
 
 		 439 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1328  histidine kinase  26.37 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 445 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 408 aa  55.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 360 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 961 aa  55.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 660 aa  55.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  34.62 
 
 		 908 aa  55.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 360 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 360 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 360 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 477 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 362 aa  55.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 529 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  28.84 
 
 		 469 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 450 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 307 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 460 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 380 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 559 aa  54.7  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  30.93 
 
 		 529 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 858 aa  54.3  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  37.82 
 
 		 480 aa  54.3  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  26.74 
 
 		 594 aa  54.3  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  36.45 
 
 		 454 aa  54.3  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2577  sensor histidine kinase  29.23 
 
 		 349 aa  54.3  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 842 aa  54.3  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  30.95 
 
 		 608 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 491 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  33.09 
 
 		 423 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 608 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 516 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2632  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.58 
 
 		 291 aa  53.9  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1279  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 360 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 360 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.1 
 
 		 581 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 395 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  28.57 
 
 		 651 aa  54.3  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  30.93 
 
 		 529 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  30.93 
 
 		 529 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  29.36 
 
 		 300 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  31.88 
 
 		 860 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 670 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 596 aa  53.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 		 977 aa  53.5  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.51 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  30.93 
 
 		 529 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 		 841 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 1096 aa  53.5  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 314 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 475 aa  53.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1772  Signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 345 aa  53.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  34.86 
 
 		 593 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 529 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  29.63 
 
 		 671 aa  53.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  26.34 
 
 		 1374 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 395 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>