More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2635 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  29.29 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  28.17 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  32.28 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  37.38 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  30.16 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  30.16 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.16 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.37 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  29.37 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  27.61 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  27.61 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  27.61 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  27.61 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  27.61 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  27.61 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  27.61 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  27.61 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  30.16 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  41.77 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  30.08 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  30.2 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  27.78 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  30.08 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  27.2 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  29.27 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  29.27 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  29.36 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  29.05 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  29.73 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  27.64 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>