231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2622 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  100 
 
 
328 aa  634    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  57.85 
 
 
331 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  58.77 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  58.84 
 
 
323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  54.32 
 
 
341 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  56.78 
 
 
332 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  54.18 
 
 
328 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  54.27 
 
 
342 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  52.47 
 
 
328 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  59.13 
 
 
331 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  52.17 
 
 
327 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  52.17 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  51.85 
 
 
334 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  43.67 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  35.47 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  35.15 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  39.04 
 
 
331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  37.84 
 
 
321 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  40.32 
 
 
338 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  36 
 
 
326 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  38.87 
 
 
338 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  34.64 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  36.59 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  34.05 
 
 
323 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  33.13 
 
 
327 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  33.44 
 
 
327 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  32.21 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  33.64 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  34.88 
 
 
333 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
486 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  36.68 
 
 
481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
479 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
471 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  24.48 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  30.47 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  29.06 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  31.97 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  27.96 
 
 
528 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  27.49 
 
 
727 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  31.06 
 
 
325 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.67 
 
 
741 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  21.85 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  31.97 
 
 
361 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  31.63 
 
 
332 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  35.56 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  29.89 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.74 
 
 
599 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  30.07 
 
 
361 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  32.35 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.71 
 
 
752 aa  56.6  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  29.08 
 
 
288 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  31.65 
 
 
325 aa  55.8  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  39.42 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  33.48 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  31.16 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  26.36 
 
 
465 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  31.22 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0536  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.55 
 
 
715 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  30.67 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  27.17 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  31.75 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.34 
 
 
794 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.69 
 
 
727 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  25.6 
 
 
332 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.54 
 
 
781 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  30.69 
 
 
314 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  26.64 
 
 
286 aa  52.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.59 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  24 
 
 
330 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  29.23 
 
 
338 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  20.21 
 
 
325 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  27.81 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  31.39 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1574  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.85 
 
 
601 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.96 
 
 
715 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  36.3 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  37.4 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  31.16 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3011  selenide, water dikinase  29.9 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.98 
 
 
737 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.4 
 
 
740 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  26.71 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.16 
 
 
737 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  35.09 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  29.17 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  29.7 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  27.05 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  28.94 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.33 
 
 
764 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  33.86 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  25 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.25 
 
 
323 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.05 
 
 
727 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
329 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  29.37 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.79 
 
 
768 aa  49.7  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2509  thiamine-monophosphate kinase  32.24 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0452713  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  25.16 
 
 
348 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  28.51 
 
 
327 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.44 
 
 
766 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>