More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2604 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  100 
 
 		 522 aa  1036    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  46.53 
 
 		 503 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  48.68 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  48.77 
 
 		 508 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  49.48 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  47.19 
 
 		 504 aa  435  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  48.28 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  48.01 
 
 		 519 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  48.16 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  44.67 
 
 		 537 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.86 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  44.83 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  43.65 
 
 		 524 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  47.17 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  47.15 
 
 		 511 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  43.63 
 
 		 525 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 525 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.15 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  43.2 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.47 
 
 		 524 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.3 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.15 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.77 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 497 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 499 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.47 
 
 		 524 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.99 
 
 		 527 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.71 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  46.33 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 516 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  43.34 
 
 		 861 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  46.14 
 
 		 509 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.42 
 
 		 497 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  46.25 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  42.75 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 523 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 508 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.41 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.24 
 
 		 516 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  42.48 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  42.12 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.18 
 
 		 495 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.06 
 
 		 521 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  43.06 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  41.63 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  42.8 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  41.43 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.4 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.22 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 497 aa  402  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.02 
 
 		 492 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.89 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  42.05 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  43.25 
 
 		 519 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.4 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40 
 
 		 494 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.41 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.69 
 
 		 514 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.97 
 
 		 501 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.39 
 
 		 517 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.59 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.39 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  40.46 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  44.26 
 
 		 524 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 		 501 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.06 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.52 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  41.06 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.06 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.52 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.51 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.82 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.52 
 
 		 516 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.06 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  42.51 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  43.03 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.46 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.06 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  43.09 
 
 		 511 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  42.22 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.06 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.51 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.51 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.52 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  37.93 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  40.85 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  43.7 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  41.2 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  39.88 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  40.61 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.61 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  39.88 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  43.94 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.74 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>