192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2512 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
605 aa  1231    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  57.02 
 
 
610 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  54.95 
 
 
608 aa  598  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  54.95 
 
 
608 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  46.15 
 
 
585 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  37.71 
 
 
592 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  36.01 
 
 
629 aa  365  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.06 
 
 
1283 aa  359  7e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  36.33 
 
 
609 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  36.16 
 
 
611 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  36.16 
 
 
609 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  35.11 
 
 
611 aa  349  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  35.53 
 
 
609 aa  349  9e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  34.4 
 
 
635 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  36.64 
 
 
609 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  35.53 
 
 
609 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  34.64 
 
 
637 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  34.54 
 
 
616 aa  347  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  35.36 
 
 
609 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  34.74 
 
 
616 aa  346  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  35.18 
 
 
609 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  36.11 
 
 
609 aa  343  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  34.91 
 
 
609 aa  342  9e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  34.61 
 
 
607 aa  341  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  35.08 
 
 
602 aa  340  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.87 
 
 
603 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  33.87 
 
 
610 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.69 
 
 
603 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.69 
 
 
603 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.51 
 
 
603 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.75 
 
 
601 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.57 
 
 
601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.57 
 
 
601 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  40.88 
 
 
619 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  35.46 
 
 
587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  35.08 
 
 
609 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.04 
 
 
603 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  32.32 
 
 
593 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  34.11 
 
 
594 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  33.57 
 
 
601 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  34.55 
 
 
615 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  36.3 
 
 
588 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.81 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.45 
 
 
617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  34.71 
 
 
589 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  32.99 
 
 
628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  35.78 
 
 
618 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  32.18 
 
 
617 aa  313  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  36.91 
 
 
605 aa  313  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  33.68 
 
 
615 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  33.1 
 
 
589 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  33.85 
 
 
615 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  34.56 
 
 
616 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  34.42 
 
 
624 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  32.99 
 
 
613 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  34.72 
 
 
616 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  32.86 
 
 
591 aa  309  9e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  34.78 
 
 
616 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  34.34 
 
 
616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  33.39 
 
 
619 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  33.66 
 
 
607 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  33.56 
 
 
613 aa  306  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  36.15 
 
 
613 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  33.51 
 
 
615 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  33.57 
 
 
599 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  33.62 
 
 
607 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  33.62 
 
 
607 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  34.7 
 
 
621 aa  303  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.33 
 
 
625 aa  302  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  33.16 
 
 
646 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  34.22 
 
 
621 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  32.32 
 
 
599 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  32.48 
 
 
627 aa  301  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  31.88 
 
 
614 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  33.79 
 
 
625 aa  299  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  33.87 
 
 
590 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  31.5 
 
 
599 aa  296  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  33.04 
 
 
598 aa  296  9e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.15 
 
 
608 aa  296  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  35.74 
 
 
584 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  33.22 
 
 
614 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  33.39 
 
 
614 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  31.42 
 
 
618 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  37.28 
 
 
551 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  33.57 
 
 
614 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  32.53 
 
 
611 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  33.51 
 
 
617 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  31.73 
 
 
583 aa  290  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.44 
 
 
622 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  32.64 
 
 
614 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  33.97 
 
 
610 aa  283  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  34.82 
 
 
633 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  31.37 
 
 
595 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  30.12 
 
 
586 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  32.16 
 
 
611 aa  280  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.55 
 
 
628 aa  273  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  37.1 
 
 
639 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  34.73 
 
 
628 aa  267  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  31.14 
 
 
609 aa  266  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  37.34 
 
 
629 aa  264  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>