54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2474 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  67.11 
 
 		 838 aa  1095    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  100 
 
 		 834 aa  1696    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5075  hypothetical protein  47.24 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2485  hypothetical protein  47.05 
 
 		 541 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4251  hypothetical protein  46.85 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3843  hypothetical protein  46.85 
 
 		 541 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  33.59 
 
 		 925 aa  230  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  34.88 
 
 		 885 aa  228  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  33.26 
 
 		 893 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1919  hypothetical protein  32.24 
 
 		 632 aa  213  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2424  hypothetical protein  32.29 
 
 		 966 aa  191  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.660613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  35.69 
 
 		 979 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  32.13 
 
 		 904 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  29.05 
 
 		 879 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  29.31 
 
 		 879 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  30.72 
 
 		 879 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  29.77 
 
 		 892 aa  99  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  42 
 
 		 930 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4122  hypothetical protein  27.37 
 
 		 899 aa  97.8  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.412369  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  28.9 
 
 		 731 aa  95.9  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  36.52 
 
 		 739 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  28.04 
 
 		 682 aa  89.7  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  29.77 
 
 		 716 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  31.15 
 
 		 712 aa  85.1  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  36.6 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  29.53 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  30.59 
 
 		 712 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  30.59 
 
 		 712 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  31.5 
 
 		 760 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  30.59 
 
 		 720 aa  82.8  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  33.2 
 
 		 755 aa  82.4  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  30.2 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  36.59 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  26.71 
 
 		 738 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  30.22 
 
 		 765 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  35.85 
 
 		 847 aa  78.2  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  38.71 
 
 		 841 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.31 
 
 		 575 aa  69.3  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4213  hypothetical protein  45.05 
 
 		 112 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.936932  normal  0.431658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  39.62 
 
 		 718 aa  65.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  30.13 
 
 		 815 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  34.19 
 
 		 845 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1537  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  61.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7053  hypothetical protein  36.84 
 
 		 102 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.496846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  29.41 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  27.22 
 
 		 732 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  36.27 
 
 		 278 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7732  hypothetical protein  46.67 
 
 		 102 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  24.87 
 
 		 701 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  48.08 
 
 		 610 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  33.96 
 
 		 895 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  34.67 
 
 		 610 aa  47.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  29.22 
 
 		 437 aa  47.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  41.79 
 
 		 788 aa  46.6  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>