190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2328 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  100 
 
 		 333 aa  670    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  80.18 
 
 		 333 aa  535  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  70.78 
 
 		 333 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  70.78 
 
 		 333 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  70.27 
 
 		 333 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  59.44 
 
 		 355 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.02 
 
 		 364 aa  425  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  62.65 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  61.45 
 
 		 332 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  65.66 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  64.86 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  65.06 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  68.07 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.87 
 
 		 354 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  58.36 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  56.46 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  63.44 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  58.56 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  59.52 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.11 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  56.8 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  59.64 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.98 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.98 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  56.67 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  56.63 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  55.59 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  58.73 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  55.76 
 
 		 332 aa  363  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  61.68 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  52.25 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.25 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  52.25 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.31 
 
 		 330 aa  360  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.92 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.96 
 
 		 356 aa  355  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  58.81 
 
 		 335 aa  349  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.99 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.02 
 
 		 354 aa  346  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.11 
 
 		 329 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.99 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  54.82 
 
 		 329 aa  342  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.79 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.36 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  54.85 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  48.6 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.31 
 
 		 331 aa  329  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.72 
 
 		 332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  48.18 
 
 		 583 aa  322  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.94 
 
 		 333 aa  322  7e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  48.18 
 
 		 583 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  48.18 
 
 		 583 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  48.48 
 
 		 583 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  48.18 
 
 		 583 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  48.18 
 
 		 583 aa  318  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  48.48 
 
 		 583 aa  318  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  48.48 
 
 		 583 aa  318  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  55.29 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.47 
 
 		 331 aa  316  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  45.45 
 
 		 582 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  51.66 
 
 		 332 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  48.18 
 
 		 583 aa  315  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  47.88 
 
 		 583 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  47.88 
 
 		 583 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.2 
 
 		 329 aa  299  6e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.43 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.19 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  48.95 
 
 		 572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  47.43 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  50.91 
 
 		 567 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  48.65 
 
 		 569 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  48.65 
 
 		 569 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  46.99 
 
 		 567 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  48.65 
 
 		 566 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  47.22 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  52.12 
 
 		 567 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  47.22 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  48.95 
 
 		 566 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  46.36 
 
 		 546 aa  269  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  43.33 
 
 		 333 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  47.89 
 
 		 616 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  44.21 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  45.35 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  47.87 
 
 		 544 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  44.38 
 
 		 333 aa  261  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  44.62 
 
 		 544 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  47.26 
 
 		 544 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  47.26 
 
 		 544 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  47.57 
 
 		 616 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  47.57 
 
 		 570 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  47.57 
 
 		 570 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  47.25 
 
 		 570 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01180  dihydroxyacetone kinase  47.13 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  45.05 
 
 		 569 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  40 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>